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賽默飛色譜及質(zhì)譜

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ASTRAL客戶之聲| 高通量與高深度兼得,拓展蛋白質(zhì)分析的極限

閱讀:525      發(fā)布時間:2023-12-3
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原創(chuàng) 飛飛 賽默飛色譜與質(zhì)譜中國

關(guān)注我們,更多干貨驚喜好禮

 

 

導語:

賽默飛在2023年ASMS上發(fā)布的全新Orbitrap Astral超高分辨質(zhì)譜儀,一經(jīng)問世立即引起了國內(nèi)學界的廣泛關(guān)注。隨之,眾多行業(yè)精英紛紛訂購這一劃時代的革命性產(chǎn)品。隨著shou批用戶的裝機,相關(guān)實測數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)布。為此我們精心匯總了shou家用戶—諾禾致源所攬獲的實測數(shù)據(jù),從細胞到血漿,從植物到動物,這款革命性的質(zhì)譜儀以其無與lun比的性能,quan方位刷新了學界對質(zhì)譜儀的認知。

 

 

 

01

Hela細胞--180 runs/天,

真正的高通量分析時代已經(jīng)來臨

采用Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀對Hela細胞裂解液樣本進行分析,分別測試8 min、15 min、24 min 的時間梯度。結(jié)果顯示,8 min 梯度(包括上樣、平衡、洗脫、有效分析時間的總時長)下蛋白質(zhì)鑒定數(shù)目可達8,000+。這意味著每天可實現(xiàn)180個樣本的分析通量,運行成千上萬樣本的大隊列分析可成為每個蛋白質(zhì)組學實驗室的日常。真正的高通量分析時代已經(jīng)來臨!

 

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24 min梯度下,鑒定數(shù)目可輕松達到 10,000+,實現(xiàn)更高深度的覆蓋。該測試結(jié)果不僅相較HF-X(1μg上樣量,90分鐘梯度)的分析深度(7285個蛋白)得到了3400+新的蛋白質(zhì)定性數(shù)據(jù),而且可覆蓋HF-X數(shù)據(jù)的98.5%。這意味著采用Astral分析平臺,不僅可以完美重現(xiàn)以往深度分析的鑒定結(jié)果,還使分析效率提升了3-4倍,同時獲得了更卓越的鑒定效果。Astral多快好省助力蛋白質(zhì)組學高深度分析。

 

02

血漿-短梯度蛋白分析深度新突破

以往,血漿蛋白質(zhì)組的復雜性限制了大規(guī)模、無偏的蛋白質(zhì)組學研究。使用Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀,對不同血漿蛋白質(zhì)組學研究方法的性能進行了比較,得到了前suo未有的優(yōu)異結(jié)果。通過去除高豐度蛋白,顯著增加了分析的深度。僅使用500 ng血漿蛋白量,在24min梯度下鑒定數(shù)目就可以超過1,200個,血漿蛋白鑒定數(shù)目提升45%。這一發(fā)現(xiàn)使得在精簡的工作流程基礎上,實現(xiàn)血漿蛋白質(zhì)組學高深度、廣覆蓋的研究成為現(xiàn)實。

 

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03

植物組織-一針上樣窮盡擬南芥蛋白定性結(jié)果成為可能

采用非數(shù)據(jù)依賴性數(shù)據(jù)采集模式(DIA), Orbitrap Astral 質(zhì)譜儀實現(xiàn)了擬南芥樣本的高深度分析。其中,擬南芥葉樣本蛋白鑒定數(shù)目達到11,195,根莖樣本蛋白鑒定數(shù)目達到12,781。值得注意的是,與 2020 年Nature公開發(fā)表的擬南芥蛋白質(zhì)深度分析數(shù)據(jù)相比,本次在 Astral 平臺僅通過2種擬南芥樣本,3次重復,在短短24min梯度分析中得到的蛋白分析結(jié)果,即可覆蓋30種擬南芥組織公開數(shù)據(jù)80%以上的蛋白。這表明通過 Astral 質(zhì)譜儀,或可實現(xiàn)僅通過單針上樣即可基本窮盡樣本蛋白質(zhì)定性結(jié)果

 

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04

動物組織-輕松擴展蛋白質(zhì)分析的邊界

使用 Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀檢測,在小鼠組織樣本可在24min梯度輕松實現(xiàn)蛋白鑒定數(shù)10,000+,肽段鑒定數(shù)目120,000+的優(yōu)異結(jié)果。其中小鼠腦組織樣本蛋白鑒定數(shù)目為11,204,小鼠睪丸組織樣本蛋白鑒定數(shù)目12,660,小鼠腎臟組織樣本蛋白鑒定數(shù)目10,544。這些測試數(shù)據(jù)進一步刷新和擴展了動物組織樣本分析的邊界,為廣大科研工作者帶來更多科技的驚喜和突破!

 

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卓越的穩(wěn)定性和定量準確性

在實現(xiàn)上述亮眼測試結(jié)果的同時,也對Astral進行了重復性和穩(wěn)定性測試。對200 ng蛋白含量的Hela細胞裂解液樣本進行3次重復進樣檢測,對所鑒定蛋白CV進行統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)3次進樣CV<20%的占比為92.7%,CV的中位值是3%(下圖左)。

使用Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀能夠精確測定由小鼠腦組織、大腸桿菌和擬南芥多種比例的混合物樣本中每種來源的蛋白質(zhì)比例,表明數(shù)據(jù)采集具有出色的準確性。該項測試中共鑒定得到 14,153 種蛋白質(zhì),包括幾乎整個大腸桿菌蛋白質(zhì)組(下圖右)。

 

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注:文中所有實測數(shù)據(jù)來自北京諾禾致源生物科技有限公司

諾禾致源(688315)成立12年以來,始終基于用戶需求不斷探索更多應用場景下的多組學整合解決方案。在蛋白質(zhì)組和代謝組學研究方面,基于高性能質(zhì)譜平臺以及樣本處理全自動化產(chǎn)線,積累了豐富的檢測及分析經(jīng)驗。此次引進賽默飛Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜平臺,將助其繼續(xù)發(fā)揮專業(yè)優(yōu)勢,以豐富的項目經(jīng)驗、優(yōu)質(zhì)高效穩(wěn)定的服務為科研工作者賦能。

 

結(jié)語

 

在諾禾致源多次測試中,Orbitrap Astral都以令人振奮的性能刷新了質(zhì)譜分析的能力邊界。如下圖所示,它將久經(jīng)考驗的 Orbitrap 分析器與全新的 Astral 分析器相結(jié)合,將 Orbitrap超高分辨的優(yōu)勢發(fā)揮到ji致的同時,兼具超快的掃描速度和超高的檢測靈敏度,集高通量、高覆蓋度,及精準定量性于一體。可全方面為DIA(數(shù)據(jù)非依賴掃描)、PTM(蛋白質(zhì)翻譯后修飾)、TMT18-plex標記定量、單細胞蛋白質(zhì)組學、大隊列分析等領(lǐng)域帶來革命性的變革,讓我們共同期待中國shou批用戶后續(xù)更多維度的測試數(shù)據(jù)。

 

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