經過絮凝反應后，水體中的膠體顆粒物脫穩并形成粒徑較大的絮體顆粒，再給過分離作用，將其由水體中去除，達到凈化水體的目的。分離作用按照分離原理的不同可分為沉淀技術和磁分離技術。 其中沉淀技術是由重力進行分離，也是應用非常廣泛的一種技術，目前使用較多的有斜管(斜板)沉淀技術、高密度沉淀技術、砂加載沉淀技術和磁加載沉淀技術等。磁分離技術是由磁力進行分離，由于絮體顆粒通過磁加載絮凝受到的磁力遠遠大于普通絮體顆粒受到的重力作用，因而磁分離技術分離速度更快，效率更高，是近年新興的一種絮凝分離技術。