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痕量分析主要應用于地球化學、材料科學、生物醫學、環境科學、表面科學以及罪證分析等領域，痕量分析是樣品中待測組分含量低于百萬分之一的分析方法，對于檢測方法的要求高。
痕量分析常用的分離，富集方法有揮發，沉淀和共沉淀，電解，液-液萃取，離子交換，色譜，萃取色譜，電泳等，在分離、富集過程中對于污染和痕量組分的損失要予以充分注意。液相色譜儀應用于復雜基質中痕量成分的定量分析，復雜微量組分的分離、純化、制備，多用于環境、食品安全、藥代動力學等方面。
液相色譜柱具有高柱效并且流動相可以控制和改善分離過程的選擇性因此高效液相色譜儀不僅可以分析不同類型的有機化合物及其同分異構體還可以分析在性質上極為相似的旋光異構體并已在高療效的合成藥物和升華藥物的生產控制分析中發揮了重要作用。
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