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高通量蛋白質(zhì)組學(xué)/ iTRAQ

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更新時(shí)間:2017-08-03 09:26:09瀏覽次數(shù):2449次

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高通量蛋白質(zhì)組學(xué)/ iTRAQ
iTRAQ試劑為可與氨基酸N端及賴氨酸側(cè)鏈連接的胺標(biāo)記同重元素(isobaric)。在質(zhì)譜圖中,任何一種iTRAQ試劑標(biāo)記的不同樣本中的同一蛋白質(zhì)表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比。
在串聯(lián)質(zhì)譜中,信號離子表現(xiàn)為不同質(zhì)荷比(114~117)的峰,因此,根據(jù)波峰的高度及面積,可以得到蛋白質(zhì)的定量信息。

 

iTRAQ

iTRAQ技術(shù)原理: 
        iTRAQ試劑為可與氨基酸N端及賴氨酸側(cè)鏈連接的胺標(biāo)記同重元素(isobaric)。在質(zhì)譜圖中,任何一種iTRAQ試劑標(biāo)記的不同樣本中的同一蛋白質(zhì)表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比。
        在串聯(lián)質(zhì)譜中,信號離子表現(xiàn)為不同質(zhì)荷比(114~117)的峰,因此,根據(jù)波峰的高度及面積,可以得到蛋白質(zhì)的定量信息。
技術(shù)特點(diǎn):
1.可同時(shí)標(biāo)記2~8 個(gè)樣本。
2. iTRAQ技術(shù)不僅可發(fā)現(xiàn)胞漿蛋白,還有膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白。iTRAQ技術(shù)可檢測出低豐度蛋白、強(qiáng)堿性蛋白、小于10KD或大于200KD的蛋白。
3.可標(biāo)記修飾后的氨基酸,因此對磷酸化蛋白等翻譯后修飾蛋白進(jìn)行定性定量研究。
4.報(bào)告離子的相對分子質(zhì)量較低(113~121),低分子量區(qū)是質(zhì)譜定性(質(zhì)量確定)和定量(豐度比較)較為準(zhǔn)確的區(qū)域,因此質(zhì)譜檢測更為靈敏可靠。

iTRAQ試劑包括三部分:

1. 報(bào)告基團(tuán)(reporter group):相對分子量為113-121Da(無120),因此iTRAQ試劑可同時(shí)標(biāo)記8組樣品。

2. 平衡基團(tuán)(balance group):相對分子量為192-184Da (無185),使得八種iTRAQ試劑分子量均為305 Da,保證標(biāo)記的同一肽段m/z相同。

3. 肽反應(yīng)基團(tuán):能與肽段N端及賴氨酸側(cè)鏈氨基發(fā)生共價(jià)連接,從而標(biāo)記上肽段 拿到蛋白樣品之后,不同組的樣品首先分別進(jìn)行等量酶切,每一個(gè)酶切得到的肽段樣品選擇一種標(biāo)記試劑進(jìn)行標(biāo)記反應(yīng)(每一個(gè)肽段至少含有一個(gè)游離的氨基進(jìn)行反應(yīng));然后將經(jīng)過不同標(biāo)記的肽段樣品混合后進(jìn)行后續(xù)的質(zhì)譜分析。

 

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PRM(靶向蛋白組學(xué))/PRM/靶向蛋白組學(xué)

PRM(靶向蛋白組學(xué))/PRM/靶向蛋白組學(xué)$r$nPRM(平行反應(yīng)監(jiān)

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