高電場強度電泳時,除了降低核酸樣品的熱效應,還需要注意以下問題:
防止凝膠破裂:高電場強度下,凝膠內部會產生較大的應力,容易導致凝膠破裂。因此,要確保凝膠的制備質量,凝膠濃度均勻、凝固充分;同時,在電泳過程中要避免電泳槽受到震動或碰撞。
避免電極腐蝕:高電場強度可能會加速電極的腐蝕,尤其是在長時間電泳或使用高離子強度緩沖液時。應選擇質量好、耐腐蝕的電極,如鉑電極;定期檢查電極的狀況,如有腐蝕及時更換;并且在電泳結束后,及時清洗電極,去除表面的電解質和雜質。
注意安全:高電場強度電泳使用的電壓較高,存在觸電風險。操作時要確保電泳設備接地良好,使用絕緣手套和護目鏡等防護裝備;在電泳過程中,不要觸摸電泳槽和電極,避免發生觸電事故。
考慮核酸分子的構象變化:高電場強度可能會使核酸分子的構象發生變化,從而影響其遷移行為。對于一些特殊結構的核酸分子,如超螺旋 DNA 或具有復雜二級結構的 RNA,可能需要在緩沖液中加入適量的輔助試劑,如尿素、甲酰胺等,以幫助維持核酸分子的天然構象,保證電泳結果的準確性。
防止樣品擴散:高電場強度下,樣品在凝膠中的擴散速度可能會加快,導致條帶變寬,分辨率下降??赏ㄟ^在樣品中加入適量的蔗糖或甘油等密度試劑,增加樣品的密度,減少擴散;同時,盡量縮短電泳時間,也有助于降低樣品的擴散程度。
準確選擇 Marker:由于高電場強度下核酸分子的遷移速度可能與常規條件不同,需要選擇合適的分子量 Marker 作為參照。最好選擇在高電場強度下遷移行為穩定、條帶清晰的 Marker,以便準確判斷核酸分子的大小和遷移情況。
確保設備穩定:電泳設備的穩定性對高電場強度電泳至關重要。使用前要檢查設備的電源、電極連接等是否正常,避免在電泳過程中出現電壓波動或設備故障,影響實驗結果。