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內毒素清除試劑盒的原理主要基于以下幾種機制：
親和吸附原理：
試劑盒中含有特定的親和吸附介質，例如多黏菌素B等配基修飾的瓊脂糖凝膠或其他固相載體。多黏菌素B可以與內毒素的脂質A部分具有高度的親和力，能夠特異性地結合內毒素。當含有內毒素的樣品通過裝有親和吸附介質的層析柱或反應容器時，內毒素就會被吸附在介質上，從而實現與樣品中其他成分的分離，達到清除內毒素的目的。
酶解作用原理：
有些內毒素清除試劑盒利用了能夠降解內毒素的酶，如內毒素水解酶。這些酶可以特異性地識別并切割內毒素的特定化學鍵，使其失去生物活性，從而達到清除內毒素的效果。例如，某些酶可以作用于內毒素的多糖鏈或脂質A部分，破壞內毒素的結構完整性，使其不再能夠引發機體的免疫反應或其他有害作用。
化學反應原理：
部分試劑盒采用化學反應的方式來清除內毒素。例如，使用一些具有特定化學基團的試劑，與內毒素發生化學反應，將其轉化為無毒性的物質。常見的如利用還原劑將內毒素的某些活性基團還原，或者利用酸堿反應等改變內毒素的化學性質，使其失去毒性。
不同的內毒素清除試劑盒可能采用不同的原理或多種原理相結合，具體的原理和使用方法會根據試劑盒的類型和生產廠家而有所不同。
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