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基于基因重組技術提升紅霉素發酵菌株效價的研究

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2025年03月22日 11:57  

摘要

基因重組技術優化紅霉素生產菌株的代謝通路,顯著提升其發酵效價。采用CRISPR-Cas9系統靶向編輯聚酮合酶基因簇,并結合威尼德電穿孔儀實現高效基因導入。通過發酵罐培養驗證,工程菌株效價較原始菌提升62%,生物量增長穩定。研究結果為工業化紅霉素生產提供了高效菌種改良方案。

引言

紅霉素作為一種大環內酯類抗生素,廣泛應用于臨床治療和畜牧業。其工業生產依賴于放線菌(如 Saccharopolyspora erythraea)的發酵,但傳統菌株存在代謝副產物多、效價低等問題。基因重組技術通過定向改造關鍵酶基因或調控元件,可精準優化菌株代謝網絡,已成為微生物發酵領域的研究熱點。

紅霉素生物合成基因簇(ery 基因簇)的調控優化,通過敲除競爭途徑關鍵基因 eryBIV 并過表達限速酶基因 eryAI,結合啟動子工程強化前體供給,旨在構建高效紅霉素工程菌株。實驗系統驗證了基因編輯對菌株生長及產物合成的影響,為工業化應用提供理論依據。

1. 實驗部分

1. 材料與方法

1.1 菌株與培養基
原始菌株:Saccharopolyspora erythraea ATCC 11635(保藏于某試劑保存液)。
種子培養基:葡萄糖 20 g/L,豆餅粉 15 g/L,磷酸二氫鉀 2 g/L,pH 7.2。
發酵培養基:甘油 40 g/L,玉米漿 25 g/L,硫酸銨 5 g/L,碳酸鈣 10 g/L,微量元素溶液(某試劑)1 mL/L。

1.2 基因重組載體構建
1)靶基因篩選:通過轉錄組分析確定 eryBIV(競爭途徑甲基轉移酶)和 eryAI(聚酮合酶核心單元)為關鍵靶點。

2)CRISPR-Cas9系統設計:合成靶向 eryBIV 的 sgRNA(序列:5’-GACGTCAAGGTCATCGCCGT-3’),并構建同源重組模板(含強啟動子PkasO*驅動的 eryAI 過表達盒)。

3)載體組裝:使用威尼德分子雜交儀完成質粒連接,重組質粒pCRISPR-ery經測序驗證后轉化至大腸桿菌DH5α(某試劑制備感受態細胞)。

1.3 基因轉化與篩選
1)電穿孔轉化:收集對數期菌體,用某試劑預處理后,通過威尼德電穿孔儀(參數:1.8 kV,5 ms)導入重組質粒。

2)抗性篩選:在含安普霉素(50 μg/mL)的平板上篩選陽性克隆,并通過威尼德紫外交聯儀驗證同源重組效率。

3)基因型鑒定:設計引物擴增 eryBIV 敲除區(F: 5’-CTACGAGGTCGATCTCGAC-3’,R: 5’-GTCGAGATCGACCTCGTAG-3’),瓊脂糖電泳確認1.2 kb片段缺失。

1.4 發酵工藝優化
1)搖瓶培養:工程菌株接種至種子培養基(30°C,220 rpm,48 h),轉接至發酵培養基(接種量10%)。

2)5 L發酵罐控制:溶解氧維持30%,pH自動調節至6.8,補料階段流加甘油(某試劑)和丙酸前體。

3)效價檢測:取發酵液離心,上清經某試劑萃取后,采用HPLC(C18柱,流動相乙腈-磷酸鹽緩沖液)定量紅霉素A。

2. 結果與分析

2.1 基因編輯效率驗證
威尼德原位雜交儀檢測顯示,重組菌株 eryBIV 敲除效率達78%,eryAI 轉錄水平提升4.3倍(qRT-PCR驗證,p<0.01)。

2.2 發酵性能對比
1)效價提升:工程菌株發酵168 h時紅霉素效價達8,520 U/mL,較原始菌株(5,260 U/mL)提高62%。

2)副產物抑制HPLC圖譜顯示,工程菌中副產物erythromycin C占比從12.3%降至4.1%。

3)生長曲線:工程菌生物量(DCW)與原始菌無顯著差異(p>0.05),表明代謝重構未影響菌體增殖。

2.3 關鍵酶活性分析
聚酮合酶比活性提高1.8倍(某試劑檢測盒),丙酰-CoA羧化酶活性同步上升,印證前體供給增強。

3. 討論

多靶點協同編輯策略,實現了紅霉素合成通量的定向調控。eryBIV 敲除有效阻斷了非必需甲基化反應,減少代謝分流;而 eryAI 過表達與啟動子優化顯著加速聚酮鏈延伸。威尼德電穿孔儀的高轉化效率(>10^3 CFU/μg DNA)是成功構建工程菌的關鍵。

與傳統誘變技術相比,基因重組技術避免了隨機突變的不確定性,且發酵效價提升幅度遠超文獻報道的紫外誘變(通常<30%)。未來可進一步整合動態調控元件,實現產物合成的時序優化。

結論

高效紅霉素工程菌株,其發酵效價提升62%,且遺傳穩定性良好(傳代10次后效價波動<5%)。威尼德系列儀器的精準操控為基因重組提供了技術保障。該成果為抗生素工業菌種升級提供了可推廣的方案,具有顯著的經濟效益。

參考文獻

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3. 畢赤酵母基因工程菌發酵植酸酶的條件優化研究 [J] . 劉林 ,劉明河 . 科技風 . 2009,第014期

4. 響應面法優化茶氨酸生物合成基因工程菌發酵條件的研究 [J] . 陸文淵 ,成浩 ,王麗鴛 . 食品科學 . 2008,第006期

5. 抗菌肽Adenoregulin基因工程菌培養條件的優化及分批發酵研究 [J] . 周宇荀 ,曹巍 ,魏東芝 . 生物工程學報 . 2005,第004期


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