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干貨 | 雙熒光素酶驗證miRNA與靶基因3’UTR相互作用!

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2025年03月19日 08:54  

在miRNA 的研究中經常會涉及到miRNA 與基因靶向關系的驗證,miRNA 通過其種子序列(5’端第2-8 個堿基)靶向結合mRNA 的3’UTR 區,誘導細胞內沉默復合體介導的mRNA降解或阻遏mRNA 的翻譯過程。基于以上原理,如圖,將目的基因3'UTR 區(或結合位點下游500bp)插入到熒光素酶報告基因載體luciferase 下游,與miRNA mimics 共轉染目的細胞,加入底物,檢測熒光素酶活性的變化。若熒光素酶活性下調,則該miRNA 與靶基因3'UTR 區存在相互作用。

 

常用載體:PGL3-CMV-LUC-MCS

圖1.miRNA與3‘UTR報告基因原理示意圖

 

雙熒光素酶報告基因檢測用于驗證miRNA與靶基因3'UTR的相互作用的工作原理主要基于以下幾個步驟

 
 

miRNA靶基因的生物信息學預測

利用生物信息學分析軟件(如TargetScan、StarBase和miRanda等)來分析特定靶基因的3'-UTR區序列是否有miRNA結合位點。

 
 
構建報告基因載體

將預測能夠與miRNA結合的靶基因3'-UTR序列插入載體中螢火蟲熒光素酶(Firefly luciferase)的3'-UTR。當miRNA和質粒中的插入序列結合后,miRNA會通過和所插入的序列結合從而抑制螢火蟲熒光素酶的翻譯,最終造成熒光值的降低。

 
 

miRNA/靶基因間相互作用的結構學驗證

通過雙熒光素酶報告基因實驗可以理解為通過熒光值來判斷miRNA是否與靶基因結合。如果miRNA與插入到質粒中的目標序列發生結合,miRNA將通過抑制該序列的翻譯來降低螢火蟲熒光素酶的表達,進而導致熒光強度的下降。這一變化可以作為miRNA與靶基因結合的指標。
 
 

miRNA與靶基因的作用機制

miRNA的基本作用機制有兩種:抑制蛋白翻譯和通過不全的miRNA-mRNA互補配對誘導靶RNA降解。miRNA通常與mRNA的3'UTR區域發生結合,通過這種方式發揮其生物學功能。
 
 

實驗步驟

構建含靶基因3'UTR的雙熒光素酶報告基因載體,合成miRNA mimics和miRNA negative control,將載體和miRNA共轉染到細胞中,最后進行雙熒光素酶檢測以確定目的miRNA的靶基因。
 
 

結果分析

實驗中,如果miRNA能夠與靶基因結合,熒光值會顯著性下降。如果結合位點發生突變,miRNA無法與突變后的靶基因結合,熒光值與未突變的對照組無顯著性差異,從而驗證miRNA與靶基因的結合位點。

 

通過上述步驟,雙熒光素酶報告基因檢測可以有效地驗證miRNA與靶基因3'UTR的相互作用,為研究miRNA的功能和調控網絡提供重要工具。

 

 

翌圣雙熒光素酶報告基因檢測服務流程:

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

 

 

詳細操作步驟:

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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材料與準備

 
  • 細胞HEK 293 細胞或目的細胞

  • 轉染試劑:可選Hieff Trans® in vitro siRNA/miRNA Transfection Reagent轉染試劑(貨號:40806ES)

  • 報告基因檢測試劑盒:Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙螢光素酶報告基因檢測試劑盒(貨號:11402ES)

  • 其他儀器耗材酶標儀、細胞培養板等

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實驗步驟

 
 
01
 

目的細胞質粒瞬轉預實驗

當選擇在目的細胞(而非293 工具細胞)中進行驗證實驗時,首先要確認目的細胞的質粒瞬轉效率,以及摸索合適的瞬轉體系,質粒瞬轉效率>40%以上時表明預實驗通過。

02
 

轉染正式實驗

a. 將狀態良好,處于對數生長期的空白細胞用0.25%胰酶消化,用培養基懸浮成單細胞懸液,細胞計數后,接種于24 孔培養板中;

b. 培養過夜,觀察細胞生長狀態。在細胞覆蓋率70%左右時,進行轉染實驗;

c. 轉染2 h 前換液為新鮮的培養基;

d. 轉染取無菌的1.5 mL EP 管,轉染參考轉染試劑使用說明書;

e. 轉染48 h 后收集細胞樣品。

03
 
報告基因檢測

A 細胞樣品收集

a. 轉染后從培養箱中取靶細胞,輕輕吸凈培養液,PBS 洗滌2 次;

b. 棄去PBS,每孔加入100 μL 的1×PLB(5X Passive Lysis Buffer 用無菌水稀釋而得);

c. 細胞裂解后,將樣品轉移入EP 管中,-80 度冰箱保存。

 

B 根據報告基因檢測試劑盒說明書操作進行檢測

a. 將充分裂解后的裂解產物,10,000-15,000 rpm 離心3-5 min。離心后將上清液移入新的

EP 管進行后續檢測。

b. Renilla Luciferase Assay 工作液的配置:按照樣品要求的量,將Renilla Luciferase Assay

Reagent(100×)按照稀釋比例加入Renilla Luciferase Assay buffer,混勻后室溫放置。

c. 熒光素酶檢測

按照儀器說明書要求將熒光檢測打開,設定參數,測定時間為10 s,測定間隔為2 s;

將樣品按照20 μL 的體積加入測量管中(保持每次樣品的加樣量一致),

另外加入20 μL Firefly Luciferase Assay Reagent 混勻2-3 次(不能漩渦混勻),充分混勻后

測定RLU(Relative light unit),同時設置Cell Lysis buffer 為空白對照孔;

將檢測后的樣品,加入20 μL 配制的Renilla Luciferase Assay 工作液混勻2-3 次,充分

混勻后測定RLU,同時設置Renilla Luciferase Assay 工作液為空白對照孔。

04
 
數據處理與分析,計算相對熒光強度

 

05
 
提供原始數據及完整性實驗報告

 

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常規檢測分組

 

(1)mimics NC+對照質粒+海腎內參(TK);

(2)mimics NC+ 3’UTR 野生型質粒+海腎內參(TK);

(3)mimics NC+ 3’UTR 突變型質粒+海腎內參(TK);

(4)mimics+對照質粒+海腎內參(TK);

(5)mimics+3’UTR 野生型質粒(WT)+海腎內參(TK);

(6)mimics+3’UTR 突變型質粒(MT)+海腎內參(TK)。

 

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實驗預期結果

 

 

 

翌圣可提供雙熒光素酶報告基因檢測服務,加快基礎研究及藥物篩選進度

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

 

 

 

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產品類別

產品名稱

產品貨號

產品規格

雙熒光素酶報告基因檢測試劑

Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙螢光素酶報告基因檢測試劑盒

11402ES60/80

100T/1000T

Dual One Step Luciferase Reporter Gene Assay Kit 輝光型雙螢光素酶報告基因檢測試劑盒

11405ES60/80

100T/1000T

轉染試劑

Hieff Trans® Liposomal Transfection Reagent 轉染試劑

40802ES01/03

100μL/1mL

Hieff Trans® in vitro siRNA/miRNA Transfection Reagent轉染試劑

40806ES01/02/03

0.1mL/0.5mL /1mL

Hieff Trans® mRNA Transfection Reagent 轉染試劑

40809ES01/03

0.1mL/1mL


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