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CUT和Tag: 新型蛋白質-DNA互作研究工具

來源:上海優寧維生物科技股份有限公司   2024年06月14日 10:17  

表觀遺傳學研究中,在分子層面研究蛋白質與DNA之間的相互作用有助于我們更深入的理解特定細胞功能和疾病發病機制。CST為了幫助科研人員更快的獲得可靠的實驗結果,進一步擴大了蛋白質-DNA互作研究產品組合,重磅推出了完整的CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)解決方案,包括CUT&Tag試劑盒(#77552)、 建庫試劑盒(#47415)、抗體和適用于細胞以及組織的實驗步驟說明書。

 

CUT&Tag實驗步驟

對于CST CUT&Tag實驗,首先將細胞與刀豆蛋白A包被的磁珠混合。洋地黃皂苷的透化處理可以讓靶標特異性的一抗進入細胞并結合目的蛋白。由于需要將信號放大,因此還要添加二抗。隨后進行預裝接頭的高活性CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded) (#79561)融合轉座酶的孵育,轉座酶進入細胞后可以通過pAG結構域與二抗結合,這樣就使轉座酶與靶標蛋白間接聯系起來。加入Mg2+激活轉座酶活性后,目標基因組 DNA 會被切割并就地連接接頭 DNA,最后進行DNA純化和PCR擴增。由于省去了體外接頭連接步驟,CUT&Tag可以節省您寶貴的時間,讓您在更短的時間內進行蛋白質-DNA相互作用研究。

 

圖1:CUT&Tag 實驗原理

CUT&Tag為何與眾不同?

雖然ChIP仍然是研究蛋白質-DNA相互作用的主要方法,但隨著新的研究工具的出現,例如CUT&RUN以及CUT&Tag,傳統ChIP-Seq實驗需要大量樣品,重復性差、高背景等問題得到了解決。CST CUT&Tag試劑盒(#77552)經過了嚴格驗證,適用于細胞和組織樣品中多種靶標類型,并包含了陽性對照抗體Tri-Mmethyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751和陰性對照抗體Normal Rabbit IgG #2729 / Normal Mouse IgG #68860,以及抗兔和抗鼠的二抗。同時,當樣品量不足時,該試劑盒還可以幫助您更快獲得實驗結果,節省測序成本,并使單細胞染色質分析成為可能。

 

圖2:CUT&Tag優勢

此外,CST還專門針對CUT&Tag驗證了多種一抗,包括組蛋白靶標和部分非組蛋白靶標,以確保實驗結果的可重復性和可靠性。

CUT&Tag 試劑為您提供高質量數據

一、組蛋白修飾分析

1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對HCT 116細胞進行CUT&Tag實驗。
 


2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對低細胞數量的NCCIT細胞進行CUT&Tag實驗。

 

 

二、轉錄因子和輔因子分析

1、使用Nanog (D2A3) XP Rabbit mAb (Mouse Specific) #8822對F9細胞進行CUT&Tag實驗。

 

 

2、使用  JARID2  (D6M9X)  Rabbit  mAb  #13594  對NCCIT細胞進行CUT&Tag實驗。

 

 

3、使用ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb #11815對低細胞數量的Hep G2細胞進行CUT&Tag實驗。

 

 

三、組織樣品分析
1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠腦組織進行CUT&Tag實驗。

 

 

2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠肝組織進行CUT&Tag實驗。

 

 

3、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠心臟組織進行CUT&Tag實驗。

 

 

CST經過嚴格驗證的一站式CUT&Tag解決方案現已全面上線:CUT&Tag試劑盒(#77552) + 一抗和二抗 + 建庫試劑盒(#47415)

CUT&Tag試劑盒和試劑

貨號產品名稱規格
77552CUT&Tag Assay Kit1 kit
79561CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded)100ul
47415CUT&Tag Dual Index Primers and PCR Master Mix for Illumina Systems1 kit
63228CUT&Tag PCR Master Mix840ul

 

部分CUT&Tag驗證抗體列表

貨號品名
8173Acetyl-Histone H3 (Lys27) (D5E4) Xpe Rabbit mAb
9649Acetyl-Histone H3 (Lys9) (C5B11) Rabbit mAb
52885Anti-mouse secondary Ab
35401Anti-rabbit secondary Ab
11815ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb
6964Bmi1 (D20B7) Xe Rabbit mAb
5856Bmi1 (D42B3) Rabbit mAb
25069CBX2 (EЗN6A) Rabbit mAb
14696CBX8 (D208C) Rabbit mAb
3418CTCF (D31H2) Xpe Rabbit mAb
9725Di-Methyl-Histone H3 (Lys4)(C64G9) Rabbit mAb
4658Di-Methyl-Histone H3 (Lys9) (D85B4) Xp® Rabbit mAb
32578DNMT3A(D2H4B) Rabbit mAb
57868DNMTЗB (E8A8A) xpe Rabbit mAb
85322EED (E4L6E) XP® Rabbit mAb
5246Ezh2 (D2C9) XP3 Rabbit mAb
5851GATA-6 (D61E4) Xp® Rabbit mAb
42427Helios (D8W4X) XP3 Rabbit mAb
13594JARID2 (D6M9X) Rabbit mAb
97800MITF (D3B4T)Rabbit mAb
14689MLL1 (D2M7U) Rabbit mAb (Amino-terminal Antigen)
14111Mono-Methyl-Histone H3 (Lys36) (D9J1D) Rabbit mAb
5326Mono-MethylHistone H3 (Lys4) (D1A9) Xp® Rabbit mAb
5232Nanog (D73G4} XP® Rabbit mAb (ChiP Formulated)
68860Normal Mouse lgG
13499Phospho-Rpb1 cTD (Ser2) (E1Z3G) Rabbit mAb
13546Phospho-Rpb1 cTD (ser2/ser5) (D1G3K) Rabbit mAb
2729Rabbit lgG
2629Rpb1 CTD (4H8) Mouse mAb
11956SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb
2569TCF4/TCF7L2 (C48H11) Rabbit mAb
9733Tri-Methyl-Histone H3 (Lys27) (C36B11) Rabbit mAb
9751Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb
5737Tri-Methyl-Histone H4 (Lys20)(D84D2) Rabbit mAb
8240ubiquityi-Histone H2A (Lys119} (D27C4) Xpe Rabbit mAb

 

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貨號產品應用
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9003SSimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads)酶解法,磁珠,可應用于ChIP,ChIP-seq
9002SSimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads)酶解法,瓊脂糖珠,可應用于ChIP
abs50034染色質免疫共沉淀(ChIP)試劑盒蛋白 A/G 磁珠,超聲法,,可應用于ChIP,ChIP-seq
86652CUT&RUN Assay KitCUT&RUN
40366CUT&RUN pAG-MNase and Spike-In DNACUT&RUN
48105CUT&RUN 4X Stop BufferCUT&RUN
42015CUT&RUN DNA Extraction BufferCUT&RUN
15338Antibody Binding Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag)CUT&RUN, CUT&Tag
3141510X Wash Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag)CUT&RUN, CUT&Tag
14209DNA Purification Buffers and Spin Columns (ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag)ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag

 

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