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高靈敏度支原體檢測

來源:上海翼和應用生物技術有限公司   2024年05月29日 10:48  

支原體(Mycoplasma):目前發現的最小原核生物,據統計約15~35% 的細胞被支原體污染。支原體污染會改變宿主細胞的結構與功能,易致實驗結果不穩定,須對培養細胞定期進行支原體檢測。

本試劑盒采用雙色熒光 qPCR (TaqMan 探針法) 檢測支原體DNA。檢測對象為細胞培養的上清液,細胞沉淀或其他生物制品。該試劑盒具有以下特點:

靈敏:配合推薦使用的核酸抽提方案,檢測靈敏度達到10CFU/ml。

       可靠:抽提加入內標核酸,全過程質量控制。

       穩定:全程閉管操作,無交叉污染。

       方便:操作簡單,無需電泳步驟。

表1   產品組分

注:

1、陽性質控含有支原體DNA和內標DNA。

2、內部質控含有內標DNA。

在實驗前請完整閱讀本說明書,務必重視注意事項和無菌操作規范!

【操作步驟】

1.樣本制備

    (1)樣本的標準制備方案:請配合使用高效無微生物污染的DNA抽提試劑盒提取樣本DNA。整個過程需要遵守無菌操作規范。本公司目前推薦抽提試劑盒見附錄3。直接取20 µL待測樣本DNA,作為模板進行 qPCR 反應。

     (2)前處理陰性樣本準備方案:將RNase Free Water當成樣本,加入內部質控,進行核酸抽提。

2. qPCR 反應液的準備

       (1)根據所要檢測樣品的數量,計算所需反應孔數,每個樣本做3個重復孔。

     反應孔數=1個陽性PCR質控+1個陰性PCR質控+1個前處理陰性質控+樣本數× 3

      (2)根據反應孔數計算所需的qPCR Mix 總量(需有1孔的加樣損失量):

     Mix =(反應孔數+1)×10 μl

      (3)各試劑放室溫融化,并根據下表所示準備 qPCR Mix:


表2  qPCR Mix的配制

3. 加樣

      (1)震蕩混勻 qPCR Mix,低速離心,將管蓋殘留液體收集至管底。

      (2)向每孔反應管中分裝 10 μL qPCR Mix。

      (3)向已分裝過 qPCR Mix 的反應管中加入15 ul石蠟油。

      (4)向反應管中加入樣品后短暫離心,加樣示例如下:

      表 3 加樣示例


【注】:此時每個反應孔的體積為30μL。

       qPCR 陰性的PCR模板為20 ul RNase Free Water。

PCR 儀設置以 ABI 7500 為例,相對定量模式,選擇TaqMan 探針法:

注:1、該程序為兩階段擴增法,如熒光定量PCR儀可以兩階段收集熒光,按照正常Ct值判斷結果;如果只能最后一步收集熒光,需要在原數據的基礎上加15個Ct值。

   2、ROX設置是以7500為例,但也存在例外,例如StepOne。


【閾值設置】

  以ABI 7500 為例,擴增曲線選擇 log 法,如果不能兩階段收集熒光,基線設置1~2個循環;如果可以,基線設置3-15個循環。建議用 log 法擴增曲線保證結果穩定可靠。

(1) 內參(HEX/VIC)閾值設定:以陽性對照定內參擴增曲線閾值,將內參的Ct 值定為 28±2。

 (2)支原體(FAM)閾值設定:以陽性對照定支原體擴增曲線閾值,將支原體(FAM) Ct 值定為 28±2 。


實驗質量控制

如果陽性對照管的支原體(FAM)Ct 值>30,但陽性對照管及前處理陰性對照管的內參(HEX)Ct 值正常,表明陽性支原體對照模板有降解。

如果樣品前處理陰性的內參(HEX/VIC)Ct 值>30,陽性對照管的內參(HEX)Ct 值>30 ,表明內參DNA存在降解或PCR體系擴增效率下降。


   【結果判讀】

根據支原體(FAM) Ct 值、內標(VIC) Ct 值判定,具體標準如下:



要求每個檢測樣品做3重復,如果3復孔中,兩重復為陽性,則判讀為陽性;建議做樣本前處理陰性,可以質控整個抽提過程。

注:檢測結果異常時:

1. 樣品前處理陰性:內參Ct值過大,表明抽提效率低;支原體檢測通道Ct值小于37.5,可能前處理抽提過程存在污染。

2. qPCR陰性:支原體和內參檢測通道Ct值小于37.5,操作過程存在污染。

3. 樣本前處理陰性質控和PCR陽性質控內參差1±1個Ct值屬于正常現象。

  【PCR過程注意事項】

由于 PCR 反應非常靈敏,實驗操作中應注意以下事項,以免發生DNA 污染:

  1.試劑盒開啟后,陽性質控和內部質控與試劑Biowing® MyqPCR Reaction Mix1、Biowing®MyPrimer&Probe Mix2、RNase Free Water、石蠟油分開存放。

   2.每個組分在使用前都應先低速離心后小心開啟。使用時請上下輕柔顛倒十次混勻,避免起泡,并低速短暫離心后使用。

  3.要求核酸抽提和qPCR過程都符合無菌操作規范。

  4.建議自備轉運盒,用于將配制分裝好的Mix從配置Mix超凈工作臺轉運到加樣超凈工作臺。

  5.建議在 qPCR 反應板上陽性對照的排布應遠離待測樣本和陰性對照。

  6.建議 qPCR 配置與分裝在一個無菌操作臺,樣本的加樣在另外一個無菌操作臺。

  7.建議使用不同的移液器添加陽性對照與待測樣本、陰性對照,并使用帶濾芯的槍頭進行加樣。

  8.應按照先加陰性,再加樣本,最后加陽性的順序加樣。且陽性用專門的加樣器。建議陽性在專門的無菌操作臺加樣。

  9.qPCR 反應板封膜或蓋蓋子時須反復壓緊。

 10.上機擴增前,反應管短時低速離心,將管壁液體收集至管底

 11.蓋上反應管蓋子或者貼上光學膜后,為避免影響熒光信號讀取,請注意不要在管蓋或者膜上做標記,或者用刮板反復摩擦。

 12.本產品僅作科研用途。




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