AAV病毒純化不再難!實(shí)用策略助你輕松應(yīng)對(duì)?
在AAV(腺相關(guān)病毒)的純化過(guò)程中,為了病毒的回收率,研究者們常常會(huì)遇到一系列挑戰(zhàn)。本文將探討這些挑戰(zhàn),并給出相應(yīng)的應(yīng)對(duì)策略,幫助大家更好地應(yīng)對(duì)AAV純化的難題。
一、高鹽濃度環(huán)境下的挑戰(zhàn)
挑戰(zhàn):為了增強(qiáng)病毒的穩(wěn)定性,我們通常會(huì)使用較高鹽濃度的buffer(200-500 mM)。然而,傳統(tǒng)的全能核酸酶在高鹽條件下活性會(huì)大幅下降,這使得去除核酸污染變得更為困難。
應(yīng)對(duì):采用耐高鹽的全能核酸酶,這類(lèi)酶在高鹽環(huán)境中依然能保持高活性,是去除核酸污染的理想選擇。通過(guò)使用這類(lèi)酶,我們可以更高效地去除殘留的核酸,提高病毒純度。
二、宿主DNA去除的挑戰(zhàn)
挑戰(zhàn):宿主DNA通常以染色質(zhì)形式存在,容易被蛋白包裹,導(dǎo)致DNA無(wú)法暴露,增加了去除的難度。
應(yīng)對(duì):在高鹽環(huán)境下,核酸和蛋白質(zhì)能有效分離。因此,我們可以在高鹽條件下進(jìn)行純化操作,使宿主DNA與蛋白質(zhì)分離,從而更容易去除殘留的DNA。
三、病毒顆粒聚集的挑戰(zhàn)
挑戰(zhàn):AAV等病毒載體會(huì)因靜電相互作用而發(fā)生聚集,尤其在低離子強(qiáng)度和殘留DNA的情況下更易聚集,這會(huì)導(dǎo)致病毒穩(wěn)定性降低和得率減少。
應(yīng)對(duì):通過(guò)提高鹽濃度,我們可以有效減少AAV病毒顆粒的聚集。這是因?yàn)楦啕}環(huán)境能夠中和病毒顆粒之間的靜電相互作用,從而防止聚集。同時(shí),確保在純化過(guò)程中去除殘留DNA,也是減少病毒顆粒聚集的關(guān)鍵。
四、純化技術(shù)選擇的挑戰(zhàn)
挑戰(zhàn):在AAV純化過(guò)程中,選擇合適的純化技術(shù)對(duì)于提高病毒回收率和純度至關(guān)重要。然而,不同的純化技術(shù)各有優(yōu)缺點(diǎn),選擇起來(lái)十分困難。
應(yīng)對(duì):我們可以采用如陰離子交換層析等先進(jìn)技術(shù)。這種技術(shù)利用完整衣殼與空衣殼之間的微小差異,通過(guò)離子交換層析實(shí)現(xiàn)高效純化。同時(shí),陰離子交換層析能夠在保持較高病毒回收率的同時(shí),提高病毒的純度。
AAV病毒純化過(guò)程中面臨的挑戰(zhàn)多種多樣,但只要我們掌握正確的應(yīng)對(duì)策略,就能輕松應(yīng)對(duì)這些挑戰(zhàn)。通過(guò)采用耐高鹽的全能核酸酶、在高鹽環(huán)境下進(jìn)行純化操作、提高鹽濃度防止病毒顆粒聚集以及選擇合適的純化技術(shù)等方法,我們可以病毒的回收率,同時(shí)保證病毒的純度。
為更好滿足AAV病毒純化過(guò)程中高鹽環(huán)境對(duì)全能核酸酶的活性要求, 逐典生物自主開(kāi)發(fā)出超耐高鹽版本全能核酸酶,在高鹽條件下,仍具有高酶活,是AAV病毒生產(chǎn)及其它生物工藝流程中去除核酸污染的理想選擇。
五,逐典超耐高鹽全能核酸酶優(yōu)勢(shì)
1.更高鹽耐受度
當(dāng)鹽離子濃度在600~700mM時(shí),初代全能核酸酶幾近失活,而SAN仍能保持較高活性。
圖1.不同鹽濃度下耐高鹽全能核酸酶(SAN)與初代全能核酸酶活性對(duì)比
2.高效核酸降解力
同對(duì)照組相比,添加SAN后能夠有效去除核酸殘留。
圖2 加入SAN 前后的消化效果圖
六,逐典耐高鹽核酸酶應(yīng)用案例:
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