酶標儀檢測移液到微孔板中的樣品產生的光信號。這些樣品的光學特性是生物、化學、生化或物理反應的結果。不同的分析反應導致用于分析的不同光學變化。吸光度、熒光強度和發光是全球實驗室常用的檢測模式。此外，還提供熒光偏振、時間分辨熒光和 AlphaScreen® 等高級模式。

基于微孔板的測量檢測由樣品產生、由樣品轉換或通過樣品傳輸的光信號。信號由檢測器測量，通常是光電倍增管 (PMT)。 PMT 將光子轉化為電能，然后通過酶標儀進行量化。此過程的輸出是量化樣本的數字。

根據反應過程中光信號變化的性質以及檢測模式，樣品可能需要被特定波長的光激發。這種光通常由寬帶氙氣閃光燈提供。為了僅通過特定波長激發樣品，燈產生的光由特定的激發濾光片或單色器選擇。為了提高靈敏度和特異性，在發射/檢測端同樣采用過濾器或單色器。它們通常放置在樣品和檢測器之間。