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KRAS靶點難成藥?-整體解決方案來幫您

來源:上海優寧維生物科技股份有限公司   2023年11月21日 14:57  

KRAS熱度已經消退了?NO...據調查,現在除傳統針對KRAS靶點小分子藥物外,更多玩家嘗試新興療法征服這一“不可成藥”的難題,如疫苗,TCR-T療法等。KRAS可以被細胞外信號以及來自細胞器等亞細胞結構的信號所激活。在正常的生理環境下,野生型KRAS主要處于不活躍的GDP結合狀態。信號促使KRAS脫離GDP,并與GTP結合,將KRAS轉化為激活狀態。激活的KRAS能夠結合并激活效應蛋白,如RAF激酶、PI3K和RalGDS,促進下游級聯的信號通路,如MAPK、PI3K和Ral-GEFs通路。這些信號通路通過細胞復制、生長、分化和促進細胞周期進程。一個激活的致癌KRAS基因導致一個突變的KRAS蛋白,由于GTP水解率大大降低,異常長時間保持其活性GTP結合狀態。當KRAS蛋白被困在“ON”位置時,下游效應通路也保持活躍,細胞增殖率保持很高。其他仍然活躍的效應通路包括那些促進腫瘤發展過程的通路,如有絲分裂、細胞遷移、腫瘤侵襲和血管生成。 一、高通量篩選試劑盒HTRF®技術提供均相,免洗KRAS結合檢測試劑盒,通過這些已驗證的試劑盒,可直接用于抑制劑篩選,無需優化,每個試劑盒配有重組蛋白、檢測試劑和緩沖液。如下圖所示,使用抗Tag1-SOS1(供體)和抗Tag2-XL665(受體)檢測Tag1-SOS1與Tag2-KRAS-G12C之間的相互作用。當供體和受體抗體由于SOS1和KRAS-G12C結合而接近時,供體抗體的激發觸發向受體抗體的熒光共振能量轉移(FRET),受體抗體在665nm處特異性發射。這種特異性信號與KRAS-G12C/SOS1相互作用的程度成正比。因此,化合物或抗體阻斷KRAS-G12C/SOS1的相互作用會導致HTRF®信號的減少。  
 使用已知抑制劑對試劑盒進行驗證,均獲得相應較好的IC50并且與已報道文獻結果相一致。 
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貨號產品名稱規格
63ADK000CB15PEGKRAS-WT/SOS1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB19PEGKRAS-WT/RAF1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB47PEGKRAS-G12D/RAF1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB17PEGKRAS-G12D/SOS1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB20PEGKRAS-G12C/RAF1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB16PEGKRAS-G12C/SOS1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB22PEGKRAS-G12V/RAF1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB28PEGKRAS G12V GTP binding kit500 tests

 二、KRAS靶點相關蛋白全部KRAS相關蛋白均已原核表達系統(E.coli)進行表達。通過HTRF方式驗證其結合活性。 1、KRAS WTThe KRAS-WT activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS- WT protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.

 

2.KRAS-G12CThe KRAS-G12C activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G12C protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal. 3.KRAS-G12D The KRAS-G12D activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G12D protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal
4.KRAS-G12R
The KRAS-G12R activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G12R protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.

5.KRAS-G12VThe KRAS- G12V activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS- G12V protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.
6.KRAS-G13C
The KRAS-G13C activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G13C protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.
7.KRAS Q61H
The KRAS-Q61H activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-Q61H protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.

8.SOS1 

9.RAF
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貨號品名規格
UA080001KRAS100μg
UA080002Kras[G12C]100μg
UA080003Kras[G12V]100μg
UA080004Kras[G12D]100μg
UA080005Kras[G12R]100μg
UA080006Kras[G13C]100μg
UA080007Kras[G13D]100μg
UA080008Kras[Q61H]100μg
UA080014cRAF50μg
UA080015cRAF50μg
UA080016SOS1100μg

*以上KRAS蛋白無GTP bound,如需GTP bound,可聯系優寧維。上述蛋白,常規規格有:50μg,100μg和1mg,如需更大規格,可聯系優寧維定制。 三、Anti-Tag抗體話說,不想用試劑盒的情況下,如何建立assay呢?蛋白已經有了,還差檢測抗體...這不就來了!Anti-Tag的HTRF熒光抗體,在實現高通量,操作簡便等其他技術優勢的同時,可以為assay的建立提供最大的靈活性。無關乎蛋白本身,僅針對標簽如His,GST,FLAG等,選擇對應的配對抗體即可實現實驗方法學開發。比如:參考上述蛋白KRAS G12C(his Tag)和SOS1(GST tag),選擇抗體配對有幾種方式可供參考:

KRAS donorSOS1 accpetor
Anti his EuAnti GST XL665
Anti GST D2
Anti His TbAnti GST XL665
Anti GST D2
KRAS accpetorSOS1 donor
Anti his XL665Anti GST Eu
Anti his D2
Anti his XL665Anti GST Tb
Anti his D2
PPI - Europium detection buffer
PPI - Terbium detection buffer 

 下圖為Anti-GST-Tb SOS1與Anti-his-XL665 KRAS G12C搭配組合展示。 
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  Anti-tag antibodies 
貨號品名規格
61HISDLFMAb Anti 6HIS-d21000 tests
61HISKLAMAb Anti 6HIS-Eu cryptate5000 tests
61HI2KLAMAb Anti 6HIS-Eu cryptate Gold5000  tests
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61MYCDAFMAb Anti cmyc-d21000 tests
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61DNPKLAMAb Anti DNP-Eu cryptate5000 tests
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61FG2DLFMAb Anti FLAG M2-d21000 tests
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61GSTDLFMAb Anti GST-d21000 tests
61GSTKLAMAb Anti GST-Eu cryptate5000 tests
61GSTTLFMAb Anti GST-Tb cryptate1000 tests
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610HADAFMAb Anti HA-d21000 tests
610HAKLAMAb Anti HA-Eu cryptate5000 tests
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61MBPDAAMAb Anti MBP-d25000 tests
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Buffers
貨號品名規格
61DB9RDF PPI - Europium detection buffer 200ml
61DB10RDF PPI - Terbium detection buffer 200ml

 三、下游磷酸化蛋白檢測Alpha®和HTRF®技術基于細胞水平進行下游KRAS信號通路的研究,包括MAPK、PI3K和Ral-GEFs通路。這些細胞信號分析能夠區分化合物調節下游KRAS通路的功效。HTRF®仍然利用夾心法原理,標記的特異性抗體識別磷酸化蛋白和總蛋白從而進行定量檢測。全過程無需洗滌,特異性好,靈敏度高。 

下圖為p-ERK(圖左)和p-NFkB(圖右)磷酸化試劑盒靈敏度與WB對比,靈敏度高出30倍不等。


與HTRF®技術不同,Alpha®雖然也是均相檢測檢測技術,但其基于化學發光原理,利用兩個微珠進行檢測來實現更低的實驗背景和超高靈敏度。一個抗體被生物素化并與鏈霉親和素包被的供體微珠結合,受體微珠則直接與另一個抗體結合。抗體與磷酸化蛋白(總蛋白)結合使供體和受體微珠靠近。供體微珠的激發使得單線態氧擴散至受體微珠,從而發射615nm波長的光信號。Alpha®的檢測信號與樣本中存在的磷酸化蛋白(總蛋白)的數量成正比。Alpha®原理如下圖。
 

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64NFBPEGNFkB phospho-S536 kit500tests
64NFTPEGNFkB total kit500tests
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64AKSPEGPhospho-AKT1/2/3 (Ser473) cellular kit500tests
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64TORPEGPhospho-mTOR (Ser2448) cellular kit500tests
ALSU-PAKT-B500AlphaLISA SureFire Ultra AKT 1/2/3 (pS473) Assay Kit500assays
ALSU-TAKT-B500Total AKT1/2/3 AlphaLISA SureFire Ultra Detection Kit500assays
ALSU-PMTOR-C500AlphaLISA phospho-mTOR (Ser2448) Assay Kit500assays
ALSU-TMTOR-B500AlphaLISA total mTOR Assay Kit500assays

 四、3D細胞增殖


基于ATP的發光法測定細胞增殖和細胞毒性的分析原理。用適當緩沖液直接裂解細胞后,對細胞ATP進行定量。在裂解細胞釋放的ATP作用下,ATP與添加的熒光素反應產生光。

ATPlite 3D and ATPlite 1step 3D Assay 操作流程如下:


ATPlite 3D檢測可以允許細胞密度較高情況下進行檢測,并且比2D檢測效果明顯。

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6066736ATPlite 1step 3D10ml/100tests
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6016941ATPlite Luminescence Assay System1000 Assay
60169475000 Assay
601694910000 Assay


四、微孔板耗材
1.3D細胞培養板①板底為高度生物相容的,超低吸附力聚合物包被du有的合成聚合物MPC,源于細胞膜組分,與極性基團的磷脂(磷脂酰膽堿)具有相同的結構,提供自然生長環境,并消除批間差異。②易形成形態大小均勻的球體細胞球體高質量形成率,細胞形態均已一致,板材的均勻性高,可隨時聚焦進行圖片拍攝,提供重復性更高的數據及更高效更高質量的成像。③無需更換培養基實驗的佳選擇圓底板,性價比高。
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6055330CellCarrier Spheroid ULA MicroplatesCase of 10
6055334Case of 40


2. 其他相關培養板,檢測板

底透微孔板(View Plate)
實驗應用顏色特點孔數目Case of 40Case of 50Case of 60Case of 160
化學發光實驗白色底透,TC處理96孔
6005181

384孔
6007480

黑色底透,TC處理96孔
6005182

384孔6007460


標準微孔板(OptiPlate)
實驗應用顏色特點孔數目Case of 40Case of 50Case of 60Case of 160
化學發光實驗熒光實驗白色非底透96孔
6005290

384孔
6007290

黑色非底透,TC處理96孔
6005270

384孔
6007270

細胞培養板(CulturPlate)
實驗應用顏色特點孔數目
Case of 50Case of 160Case of 200
細胞培養白色非底透,TC處理24孔
6005168

96孔
600568060056886005689
384孔
600768060076886007689
黑色非底透,TC處理96孔
600566060056686005669
384孔
60076606007668
             HTRF*Alpha檢測微孔板
應用領域顏色特點孔數目Case of 25Case of 50
Case of 200
HTRF實驗白色非底透,潛孔96孔66PL96025

6005359
Alpha實驗384孔
6008280
6008289


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