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用這個(gè)技術(shù)建方法,輕松發(fā)文章!

來源:德國(guó)賽多利斯集團(tuán)   2023年11月16日 10:15  

Octet® 非標(biāo)記分子互作系統(tǒng)基于非標(biāo)記的生物層干涉技術(shù)(Biolayer Interferometry, BLI)。雖然這項(xiàng)技術(shù)已有20年的歷史,但它仍被視為一項(xiàng)較新的技術(shù)。盡管歷史不長(zhǎng),但該技術(shù)發(fā)展非常迅速,相關(guān)應(yīng)用文章數(shù)量已經(jīng)超過了12,000篇,且其中相當(dāng)一部分文章的影響因子較高(1區(qū)文章)。由于其創(chuàng)新性,這項(xiàng)技術(shù)具有顯著的優(yōu)勢(shì),同時(shí)它簡(jiǎn)單易用,能在短時(shí)間內(nèi)能得到可重復(fù)的準(zhǔn)確結(jié)果。只要您有好的構(gòu)思,僅用一臺(tái)儀器的數(shù)據(jù)就足以發(fā)表文章啦!



今天,陳老師就介紹一些最近發(fā)表的利用BLI開發(fā)方法的文章,其中Octet®數(shù)據(jù)占據(jù)了文章總數(shù)據(jù)的80%以上!


利用大腸桿菌放大濃度檢測(cè)信號(hào)[1]

我們可以通過利用一些大分子量的顆粒提高生物層干涉技術(shù)(BLI)的檢測(cè)靈敏度。隨著人們對(duì)使用蛋白質(zhì)組裝功能材料的興趣日益增強(qiáng),Sup35NM 淀粉樣蛋白原纖維因其理想的蛋白支架而備受關(guān)注。華南理工大學(xué)和萬孚的科學(xué)家們將 Z 結(jié)構(gòu)域(能與抗體Fc結(jié)合)與蛋白質(zhì) Sup35NM 融合,表達(dá)在大腸桿菌表面(功能化大腸桿菌),并與抗體形成復(fù)合物。這樣,BLI生物傳感器上的分析物上就加載了抗體偶聯(lián)的大腸桿菌細(xì)胞,光學(xué)厚度發(fā)生了顯著的變化,從而增強(qiáng)BLI信號(hào)。科學(xué)家們使用了兩種模型抗原 NS1 和 PIC,采用夾心法擴(kuò)增信號(hào)。在優(yōu)化條件下,NS1的檢出限從93.98 ng/mL降至0.82 ng/mL,PIC的信號(hào)也提高了8.4倍。研究結(jié)果表明,功能化大腸桿菌可快速且靈敏地放大生物傳感器的信號(hào)。

 

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圖1. 利用功能化大腸桿菌對(duì)BLI信號(hào)放大的示意圖:首先使用Octet® 生物傳感器固化第一抗體,封閉后結(jié)合分析物,然后添加功能化大腸桿菌和二抗的混合物,以放大BLI信號(hào)。

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圖2. 左圖展示了單獨(dú)二抗的BLI結(jié)合曲線圖(藍(lán)色線),以及二抗和功能化大腸桿菌混合的BLI結(jié)合曲線圖(黃色線);

右圖為不同NS1抗原濃度下,單獨(dú)二抗和二抗/功能性大腸桿菌混合的BLI終點(diǎn)信號(hào);

結(jié)果顯示,功能性大腸桿菌可以將信號(hào)提高一倍以上。


整個(gè)檢測(cè)過程只需 30 分鐘,比傳統(tǒng)的免疫化學(xué)方法快很多,且自動(dòng)化程度高,Octet® 可以在免疫診斷中大顯身手。


環(huán)境樣品之間的相互作用方法開發(fā)[2]

微生物胞外聚合物(EPS)可以與磺胺類藥物結(jié)合,這可能影響生物廢水處理系統(tǒng)中抗生素的去除效果。華東師范大學(xué)上海有機(jī)固廢生物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心的科學(xué)家們利用Octet® 建立了一種測(cè)定EPS與磺胺類藥物(磺胺甲噁唑,SMX)結(jié)合動(dòng)力學(xué)和親和力的方法,該方法包括在各種環(huán)境條件(如pH值、離子強(qiáng)度和溫度)對(duì)這種結(jié)合相互作用的影響。結(jié)果表明,Octet® 能夠快速準(zhǔn)確地測(cè)定EPS與SMX相互作用的結(jié)合/解離速率常數(shù)和結(jié)合親和力。Octet® 結(jié)合曲線的高重現(xiàn)性證明了BLI方法的可靠。相比于中性或堿性條件下相比,EPS和SMX在酸性條件下的結(jié)合相互作用得到顯著改善。較高的離子強(qiáng)度和較低的溫度使EPS和SMX之間的結(jié)合更強(qiáng)。BLI分析允許同時(shí)進(jìn)行多通道操作,大大縮短了測(cè)試時(shí)間。本研究開發(fā)的BLI方法為探測(cè)復(fù)雜環(huán)境樣品之間的結(jié)合相互作用提供了強(qiáng)大的工具。

 

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圖3. (a) 展示了使用AR2G傳感器(氨基偶聯(lián)傳感器)固化SMX后,通過衰減全反射傅立葉紅外光譜檢測(cè)傳感器表面結(jié)構(gòu),證明SMX已經(jīng)固化成功

(b) 用Octet® 檢測(cè)SMX抗體的結(jié)合,證明SMX的活性

(c) 展示了EPS的結(jié)合以及良好的重現(xiàn)性

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圖4. 不同pH (a),離子強(qiáng)度 (b),溫度 (c) 對(duì)EPS結(jié)合的影響。

 

小分子固化穩(wěn)拿把纂,Octet® 的重現(xiàn)性也讓人放心!

 

疫苗血清篩查[3]

流感病毒表面蛋白血凝素(HA1)的球狀頭部結(jié)構(gòu)域是疫苗引發(fā)的中和抗體的主要靶標(biāo)。HA1上某些氨基酸殘基位點(diǎn)在與流感疫苗產(chǎn)生的多克隆血清抗體的結(jié)合中占主導(dǎo)地位。因此,鑒定HA的主要結(jié)合表位對(duì)于選擇季節(jié)性流感疫苗病毒至關(guān)重要。美國(guó)疾病預(yù)防控制中心開發(fā)了一種基于生物層干涉法(BLI)的測(cè)定法,使用(H1N1)pdm09病毒株的重組 HA1 蛋白來確定流感疫苗抗體反應(yīng)中的主要結(jié)合表位。他們合成并表達(dá)了一系列含有多個(gè)單個(gè)氨基酸HA1突變體庫,并用Octet®測(cè)試接種了2010 - 2011年流感三價(jià)疫苗的個(gè)體的血清與 HA1突變體庫的結(jié)合,并與血凝抑制(HI)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行對(duì)比。結(jié)果顯示,與野生型相比,幾種突變型 HA1 的 BLI 結(jié)合信號(hào)減少了50%以上,并且 BLI 和 HI 測(cè)定存在很強(qiáng)的相關(guān)性。該研究展示了一種系統(tǒng)分析流感疫苗體液反應(yīng)中抗體免疫優(yōu)勢(shì)的方法。

Octet® 系統(tǒng)測(cè)試方法:將rHA1蛋白偶聯(lián)到HIS1K生物傳感器(專門捕獲his標(biāo)簽蛋白的傳感器,可再生!)中,然后結(jié)合免疫流感疫苗的血清。基線120秒、血清結(jié)合 300 秒和解離 120 秒。用結(jié)合步驟的BLI信號(hào)量化血清抗體與重組蛋白的結(jié)合能力。結(jié)果與野生型(WT)rHA1 結(jié)合的百分比表示,如果結(jié)合信號(hào)減少 ≥50%,則認(rèn)為該氨基酸位點(diǎn)為抗血清結(jié)合位點(diǎn)。

 

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圖5. 左圖:S2(疫苗接種后)的血清抗體滴度比S1(疫苗接種前)的滴度明顯升高(Y軸為抗血清BLI結(jié)合信號(hào));

右圖:S2樣品Octet® 檢測(cè)結(jié)果與HI結(jié)果相關(guān)度高。

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圖6. Octet® 檢測(cè)rHA1突變體與血清樣品的結(jié)合信號(hào):每條代表三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)結(jié)果的中位數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)差;“*”表示與野生型相比,導(dǎo)致結(jié)合減少或增加≥50%的突變,可以發(fā)現(xiàn)N125, K130和K163是主要的抗體結(jié)合位點(diǎn)。

 

利用Octet® 系統(tǒng)以高通量、快速、低成本的檢測(cè)多個(gè)突變體和血清樣品,這種方法在流感監(jiān)測(cè)中的應(yīng)用將有助于改善疫苗病毒的選擇。


使用Octet® 建立方法有以下優(yōu)勢(shì)

  • 自動(dòng)化程度高,通量大

  • 實(shí)時(shí)免標(biāo)記技術(shù),可以監(jiān)控每個(gè)步驟

  • 結(jié)果準(zhǔn)確,可重復(fù)

  • 一次實(shí)驗(yàn)一般10-20分鐘就可以出結(jié)果

  • 耗材相對(duì)便宜

  • 使用和維護(hù)簡(jiǎn)單

 

在這些優(yōu)勢(shì)的加持下,Octet® 在建立方法可以快速篩選實(shí)驗(yàn)條件,并通過方法驗(yàn)證。

伙伴們,立即多用用手中的Octet® 發(fā)文章吧!



 

-參考文獻(xiàn)-

 

[1] Escherichia coli surface-displayed by Sup35NM nanofibrils and Z-domainsfusion protein for signal enhancement in a biolayer interferometry-based immunoassay. Sensors and Actuators: B. Chemical 390 (2023) 133938

[2] Multichannel Biolayer Interferometry to Probe the Binding ofMicrobial Extracellular Polymeric Substances to Sulfamethoxazole. ACS EST Water 2023, 3, 2449−2457

[3] Use of Biolayer Interferometry to Identify Dominant Binding Epitopes of Influenza Hemagglutinin Protein of A(H1N1)pdm09 in the Antibody Response to 2010–2011 Influenza Seasonal Vaccine. Vaccines 2023, 11, 1307.

 


 

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