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毛細管電泳（Capillaryelectrophoresis，CE），通常選用內徑為20-100μm的熔融石英毛細管作為分離通道，在毛細管兩端施加高的直流電壓提供驅動力，是一種根據樣品中各組分遷移率的不同而使樣品實現分離的分析技術。毛細管電泳為從無機離子到大分子聚合物或蛋白質等帶電荷物質提供了高效和高分離度快速分離，可以輕松實現用液相色譜通常很難完成的分離，同時還能采用不同的分離機理提供基于化合物在電場中淌度（質量/電荷）的額外正交數據。
毛細管電泳的分類：
毛細管電泳的分類：
1.按分離模式劃分：
毛細管電泳根據分離模式不同可以歸結出多種不同類型的毛細管電泳，見表1。毛細管電泳的多種分離模式，給樣品分離提供了不同的選擇機會，這對復雜樣品的分離分析是非常重要的。
2.按操作方式劃分：
毛細管電泳可以按操作方式重新分為手動、半自動及全自動型毛細管電泳。
3. 按分離通道形狀劃分：
按分離通道形狀分為圓形、扁形、方形毛細管電泳等。
4. 按緩沖液的介質劃分;
根據配制緩沖液的介質的不同，可以把CE分為水相毛細管電泳和非水毛細管電泳
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