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一、應用原理描述：
(1)設計用于合成結構上類似DNA或RNA的寡核苷酸的自動化儀器。
(2)一般應用于固相合成法，每次將一個核苷酸加到所接長的寡核苷酸鏈上，加入每一個核苷酸都利用相同的化學反應與相應的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用。
(3)所用化學反應和操作細節隨不同的儀器而改變，廣泛應用的方法是DNA合成的磷酸酰胺法。
二、性能與構造：
(1)DNA合成儀采用一定壓力的惰性氣體(氬氣)或氮氣及電磁閥組驅動液體試劑，也可采用氦氣驅動試劑。某些合成儀采用sliderblock滑塊系統及精密蠕動泵，可不采用氣體為驅動系統。
(2)采用氣體及電磁閥驅動液體試劑時，需首先將管路系統電磁閥前段，含試劑瓶組中壓力加壓到規定氣壓，通過合成管理軟件或手動打開電磁閥(一般打開時間為數ms)，即可驅動液體試劑到所需的合成柱中。
(3)DNA合成儀一般帶有鋰電池，可以使用幾年。當主電源斷開時，所有的合成參數都被保留下來。這些參數包括儲存的DNA序列，用戶設定的循環、步驟和功能，以及瓶子使用資料等。如果正在合成中電源出現故障，合成將被中斷，只有主電源恢復時合成才可重新開始。電池還保持合成儀內部的時鐘計時。
三、控制器指導和初始合成儀的所有活動，它的主要部分是軟件、微處理機、顯示屏幕、鍵板及相關的電子部件。軟件控制合成的所有必要操作并由微處理機來解釋和執行。軟件儲存在一個可取出的存儲卡中，這個存儲卡插在儀器的背面。合成信息顯示在液晶顯示屏上，通過選擇鍵板上的鍵可與儀器交流。軟件是“菜單驅動”，通過按適當的鍵，可選擇一項，給予指令。為了完成自動合成，軟件應用一個包含一系列步驟的循環來完成全部化學反應。
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