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一、用于合成結構上類似DNA或RNA的寡核苷酸的自動化儀器。一般應用于固相合成法，每次將一個核苷酸加到所接長的寡核苷酸鏈上，加入每一個核苷酸都利用相同的化學反應與相應的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用。所用化學反應和操作細節隨不同的儀器而改變，廣泛應用的方法是DNA合成的磷酸酰胺法。
二、原理組成：
(1)DNA合成儀采用一定壓力的惰性氣體(氬氣)或氮氣及電磁閥組驅動液體試劑，也可采用氦氣驅動試劑。某些合成儀采用sliderblock滑塊系統及精密蠕動泵，可不采用氣體為驅動系統。采用氣體及電磁閥驅動液體試劑時，需首先將管路系統電磁閥前段，含試劑瓶組中壓力加壓到規定氣壓，通過合成管理軟件或手動打開電磁閥(一般打開時間為數ms)，即可驅動液體試劑到所需的合成柱中。
(2)試劑輸送系統包括兩個試劑閥塊(8堿基儀器有3個)及2個或4個柱閥塊。閥塊控制氣體和化學試劑流入柱子及出口。除亞磷酰胺和四唑以外，試劑和溶劑都被同時輸送到所有活化柱。當有多個活化柱時，對流速的細微變化，以自動調節每個柱子的輸送次數來補償。每一個5—端口柱閥塊將流出物導入廢液口、DMT收集口，或DNA收集瓶，它也控制用于除去或沖洗柱內和柱閥塊內的試劑的氬氣。
(3)試劑通過底部的luer接頭，流到柱子，如果沒擰上下面的一個luer接頭，應會在一個圓柱形的玻璃流路節流閥上發現。試劑通過流路節流閥中一個很小的通道流到柱子。小量的試劑可以在流路節流閥中結晶，長期這樣會造成流路阻塞。
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