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旋轉蒸發儀一旦吸附了灰塵、污垢，不但會影響其性能，縮短使用壽命，更為嚴重的是，直接影響了實驗結果。設備在使用或貯存過程中，多多少少會沾上灰燼塵埃，所以旋轉蒸發儀的維護應以防塵防污為主，定期的除塵清洗就是做好儀器的保養和維護的重要工作。
在實際應用中，要使旋轉蒸發儀發揮好的實驗效果，必須遵守儀器的使用操作規范：
1. 安裝旋轉蒸發儀時要注意確保真空度，不要出現漏氣現象。
密封接口、密封圈、儀器接頭安裝前都需要先涂一層真空脂。安裝完成后夾住真空皮管，觀察真空表，檢查儀器是否保持真空，至少要觀察確保5分鐘不漏氣。如有漏氣，檢查密封接口和密封圈是否安裝好了，玻璃器件是否有裂縫、破碎的現象。
2. 玻璃零件要輕拿輕放，每次安裝前確保玻璃儀器已經洗凈、烘干。
3. 避免儀器干燒，加熱槽通電前必須加水，水量不要過多，以免儀器旋轉過程中水溢出加熱槽。平底燒瓶內液體高度不要超過瓶身的三分之一。
4. 使用時要先抽小真空，再開旋轉；停止時要先停旋轉，通氣，待真空度將至0.04MPa左右再停真空泵。開關過程中用手扶蒸餾燒瓶，以免壓力變化導致蒸餾瓶脫落摔碎。
5. 根據溶液的性質，設置合理的轉速。轉速過快容易出現漏氣甩出或倒吸的情況，轉速過低則工作時間過長。若溶液的粘度很大，轉速不易過快。
若蒸發的溶液屬于極易沸騰的液體，可以降低旋轉速度，或者為其配備特殊的冷凝管，避免出現煮沸或者倒吸的現象。
6. 根據蒸發物品的特性設定合適的真空度和加熱溫度。以溶液不會暴沸為宜。
7. 蒸發完成后，待轉速降至0再取下平底燒瓶，不要提前拿下，以防出現危險。旋轉蒸發儀接收瓶中的廢液不要直接倒入下水道，應放入專門的廢液瓶中處理。
8. 儀器工作結束以后，及時關閉開關，并拔下電源。用軟布擦凈留在機器表面的各種污漬，清洗燒瓶，保持儀器清潔。
9. 聚四氟開關擰緊時不可過度用力，以免損壞玻璃。停機后將聚四氟開關稍微擰松，因為開關長期處于工作狀態會使聚四氟活塞變形。
10. 定期對密封圈進行檢查和清潔。用軟布將密封圈擦拭干凈，然后涂上真空脂，重新裝回。
11.小心操作，避免儀器的電氣部分進水，若內部電控部件出現故障，必須由專業人員操作檢修，請勿自行拆裝，以免發生危險或損壞儀器。
12.如濃縮不穩定化合物時，在最后放氣與大氣相連的時候，一定要緩慢放氣，防止氣流的沖擊，使得不穩定的化合發生分解導致爆炸。
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