應用領域：

在水產品和肉類制品中的應用：針對溶菌酶無毒、無害的特性，同時對細胞壁的分解作用，應用于水產品和肉類制品中，在保證食品原有營養成分不受損失的前提下，可以對水產品和肉類制品起到保鮮和防腐作用；利用溶菌酶與氯化鈉和亞硝酸鹽聯合應用，可以延長肉制品的保質期，其防腐效果比單獨使用時效果更好；試驗用0.05%的溶菌酶與植酸、磷酸鹽、甘氨酸等配合使用，作為防腐劑和保鮮劑可以對海產品和水產品延長儲存期。

在其他食品中的應用：奶油蛋糕是容易變質的食品之一，在糕點中加入溶菌酶，可防止微生物引起的變質現象發生；將溶菌酶應用于食物的保鮮中，其效果也極為明顯。同時根據溶菌酶無毒、無害且有保健作用，有抗感染和增強抗生素的效力，以及促進血液凝固及止血和組織再生作用，在食品中作為添加劑增強食物的保健功效。

畜禽飼料中的應用 ：

用作飼料防腐劑和殺菌劑由于溶菌酶本身是一種天然蛋白質，無毒性，是一種安全性高的飼料酶，它能專一性的作用于目的微生物的細胞壁，而不能作用于其它物質。該酶對革蘭氏陽性菌、枯草桿菌、耐輻射微球菌有很強分解作用;對大腸桿菌、普通變形菌和副溶血弧菌等，革蘭氏陰性菌也有一定的殺滅作用;與聚合磷酸鹽和甘氨酸等配合使用，具有良好的防腐作用。在飼料中添加溶菌酶可防止霉變，延長飼料的貯存期，減少不必要損耗。