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酶標儀作為一個常用的儀器，其基本功能不外乎一個比色測定，與比色計所不同的是在測定波長范圍、吸光度范圍、光學系統、檢測速度、震板功能、溫度控制、定性和定量測定軟件功能等方面的差異，當然全自動酶免疫分析系統還具有自動洗板、溫育、加樣等功能。我們在選購酶標儀時應該考慮如下幾個關鍵參數：
濾光系統
酶標儀簡單的是用濾光方式來劃分。一般來說，可以分為濾光片型和光柵型兩大類。也有一些酶標儀里面同時裝上了濾光片和光柵。但是濾片和光柵并不能同時完成同一個檢測，本質上還只是把濾片和光柵放在了一起，并沒有使兩者糅合而產生新的技術突破。
光柵型濾光系統具有使用方便，可以進行光譜掃描，靈活性等優點。當然，濾光片系統也有其顯著的優勢，例如價格較為便宜，檢測靈敏度高，帶寬的可選擇性，可以進行快速的濾光片切換，可配備有自動加樣系統，在化學發光檢測中光線的透過率高。
測定波長
酶標儀有單波長和雙波長檢測功能。有時使用者不知在什么情況下使用單或雙波長檢測。所謂的“單波長”就是使用一種對顯色具最大吸收的波長即450 nm或492 nm進行比色測定；而“雙波長”則除了用對顯色具最大吸收的波長即450 nm或492 nm進行比色測定外，同時用對特異顯色不敏感的波長如630 nm進行測定，酶標儀最后打印出來的吸光度則為二者之差。630 nm波長下得到的吸光度是非特異的，來自于板孔上諸如指紋、灰塵、臟物等所致的吸收。因此，在ELISA比色測定中，最好使用雙波長，且不必設空白孔。
測定的吸光度范圍
通常，酶標儀的吸光度測定范圍在0～2.5之間即可以滿足ELISA的測定要求。早期的酶標儀可測定的吸光度一般在0～2.5之間，但現在基本上都做了拓寬，可達到3.5以上，并且能保持很好的精密度與線性。因此，對于酶標儀的吸光度范圍不必去刻意追求大的吸光度范圍，主要要看在一定的吸光度范圍內的線性和精密度如何。
光學系統
酶標儀的光學系統采用的是垂直光路多通道(通常為8或12通道，亦有單通道)檢測，一般為硅光管或光導纖維，除測定通道外，有的酶標儀還有一個參比通道，每次測定可進行自我校準。酶標儀的光學系統功能如何，均可通過酶標儀測定的吸光度范圍、線性度、精密度和準確度等體現出來。光學系統好的話，則上述指標也應較佳。測定的精密度與測定通道之間的均一性有直接關系。單通道可避免因通道不同所致的差異。
溫育功能
溫育功能是指酶標儀本身能按要求自動精確地控制儀器內部的溫度，使得ELISA測定中微孔板條的溫育過程可在儀器內部完成，而無需再外配溫箱。目前，只有少部分酶標儀具有此種功能，溫育功能只是酶標儀的一個附加功能，是否具有并不能說明酶標儀檔次的高低及儀器的優劣。作為實驗室是否選擇，則可根據自己實驗室的條件及需要來決定。
軟件功能
軟件功能是指酶標儀所具有的對ELISA定性和定量測定及其他測定方式如酶標動力學、紫外和凝集等數據的統計分析并報告結果的功能。軟件功能是中高檔酶標儀的一個非常重要的功能。如果硬件方面區別不大，則軟件就成為判定酶標儀優劣的惟一指標。對于用戶來說，好的軟件功能，對實際工作會有較大的幫助。
檢測速度
酶標儀的檢測速度是指其完成比色測定所需要的時間。檢測速度快，有利于提高檢測的精密度，即避免由于測定過程中，因測定時間不同所致的各微孔間吸光度間的差異。目前市場上常見的酶標儀檢測速度都非常快，通常在數秒鐘內。
震板功能
酶標儀的震板功能是指酶標儀在對ELISA板孔進行比色測定前對其進行振蕩混勻，使板孔內顏色均一。目前市場上常見的酶標儀均有震板功能，所不同的是震板方式，有的可按上下、左右或旋轉等方式及振蕩幅度等任意調節；有的則較為固定。使用有震板功能的酶標儀，在進行ELISA測定顯色反應完成加入終止劑后，可不必振蕩混勻，直接放人酶標儀上測定即可。
語言界面
通常進口的中高檔酶標儀人機對話多采用英文。這對于某些基層實驗室可能會存在語言方面的困難，從而難以最大限度地發揮酶標儀的作用。為解決這方面的問題，已有一些酶標儀采用了中文界面。這樣就大大方便了廣大基層實驗室技術人員的使用。
綜上所述，盡管酶標儀的發展極為快速，種類繁多，功能也不斷加強，但其最根本的功用是不變的，即比色測定。大凡比色測定，其基本要求就是在一定吸光度范圍內要有好的測定準確性、線性和精密性。同樣的吸光度范圍，測定的準確性、線性和精密性越好則酶標儀亦越佳。
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