玉米考種系統主要應用在農業領域的田間作物測產及考種等，通過攝像頭拍攝照片，軟件自動計算種子數量，種子的面積、周長、長度、寬度、長寬比等數據，根據天平所得的重量與種子的數量自動計算出千粒重，不僅如此，該儀器還具有獨立的數據管理系統，對處理之后的數據可進行統一管理，并能實現數據查看，圖片管理，數據查詢以及數據導出等功能，在快速采集玉米穗部考種數據的同時保存果穗圖像以備追溯。

實質上，室內考種就是室內選擇，其主要任務是進一步考察作物的特征特性，以彌補田間觀察選擇之不足。在傳統的種子育種中，考種工作人員需要使用尺子來測量玉米的穗長、穗粗、軸粗、種粒的長寬度，粒高，還需要肉眼數行粒數觀看玉米的胚芽等，在這過程中需要花費很長的時間并且步驟繁瑣，而且工作人員長時間的觀看非常容易因為視覺疲勞而出現錯誤。因此針對這些缺陷，玉米考種系統的研發和應用，很好的滿足室內考種的需要。

現代農業的發展離不開農業育種工作，考種系統在現代農業育種中的應用為考種工作提供了很大的便利，大幅度的減輕工作人員的負擔，節省大量的時間以及人力物力，同時也推動農業育種的發展。