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毛細管電泳儀是一類以毛細管為分離通道、以高壓直流電場為驅動力的新型液相分離技術。廣泛應用于生物、化學、醫藥行業，其分離范圍覆蓋了從離子、化合物等小分子，到蛋白、核酸、糖類等大分子甚至細胞和病毒等。尤其在離子、堿性藥物、蛋白等極性化合物的分離中具有突出優勢。
該設備采用紫外檢測原理基于被測組分和背景電解質的吸光度不同，當被測組分通過檢測窗時，吸光度發生的變化服從朗伯-比爾定律，即在一定的實驗條件下，吸光度與被測組分的濃度成正比。
毛細管電泳儀的操作步驟：
1. 將設備放置于有空調的房間，保持室溫恒定。同時，操作中控制毛細管及儀器恒溫。
2. 緩沖液加壓一段時間后，淌度和電滲流會變化，要經常更換。
3. 緩沖液要用0.45mm微孔濾膜過濾后使用。
4. 對未涂漬的毛細管柱每天使用前先用0.1mol/L氫氧化鈉溶液、水及運行緩沖液各沖洗10min平衡后使用。更換緩沖液時，要用水沖洗3min后，再用緩沖液沖洗10min平衡后進樣。
5. 樣品宜溶于稀釋5～10倍的運行緩沖液中，以獲得好的峰形。
6. 為提高定量準確性，宜加入一內標。在保證峰形的前提下，樣品宜用高濃度，進樣時間應大于5psi×sec。
7. 摸索實驗條件時，可先用一短柱，用磷酸鹽、硼砂或Tris在不同的pH值條件下試驗，當選定緩沖液種類時，可先改變pH值獲得*佳分離，再改變濃度以獲得較好的峰形及柱效。
8.實驗結束后，用水沖洗5min，可將毛細管兩端置于水中保存，也可用氮氣吹干后保存。
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