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細胞破壁的原理：
破壁后，細胞內的水份油份遷出，使微粒子表面呈現出半濕潤狀態，粒子和粒子之間會形成穩定的粒子團，每個粒子團都包含相同比例的中藥成分。該粒子團的物理結構隨組份中各成分HLB值(親水，親油平衡值)、延展性、破碎性、比重等不同組合和不同的相互作用而不同，這種結構有利于人體對中藥的吸收和利用。
細胞破壁的注意事項：
1、確保具備足夠的初始材料，可以使用相同的試劑多次嘗試，因為可能需要調整條件。這對于利用酶法制備原生質球尤為重要。
2、為了得到活的原生質體，起始物質應該處于生命的全盛時期。所以選擇從幼嫩的植物組織開始，或者在生長的對數階段積極地進行細胞培養。非常年輕的組織通常很小，他們更容易受到傷害，這增加了他們在處理中可能無法存活的幾率。另一方面，老的組織不容易再生，更容易感染。
3、在進行任何處理前將細胞冷卻并保持是很重要的，保持細胞低溫可以減緩壞死。但保持細胞溫度高于冰點也是至關重要的，因為即使是在介質中短暫形成的冰晶也會損害細胞，減少產量。
4、原生質球對機械壓力和滲透壓非常敏感。為了防止它們破裂，需要維持等滲條件，這意味著細胞內外的滲透壓應該相等，滲透壓取決于鹽離子的濃度，不平等的壓力會導致細胞破裂（低滲溶液）或內爆（高滲溶液）。
5、即使是細胞的年齡和酶的批次之間的細微差別，也會形成不*的細胞壁消化和過度消化之間的對比，前者原生質球產量為50%，后者導致大量死亡細胞。在大多數實驗中，不需要*移除細胞壁——部分移除細胞壁的原生質球就可以了。
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