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氦離子色譜儀主要由流動相傳送部分、分離柱、檢測器和數據處理四大部分組成，分離原理也是通過流動相和固定相之間的相互作用，使流動相中的不同組份在兩相中重新分配。由于各組份在分離柱中的滯留時間有所區別，從而達到分離的目的。在將分離后的各個成分依次通過一高靈敏度的檢測器時就可檢測出各離子成分的濃度來，它具有GX、快速、準確的優點。
氦離子色譜儀至少每隔3天通一次去離子水，隔七天通一次淋洗液，離子色譜柱每使用倆個月，需用0.2mol/L的Na2CO3溶液及1%酒石酸溶液洗滌，以維持色譜柱的性能，色譜柱若長時間不用，則應通入3%的硼酸密封連同YZ器低溫保存，平流泵用去離子水沖洗干凈。淋洗液不可隔天使用，以免滋生細菌，影響色譜柱的使用壽命，為延長色譜柱的使用壽命，最好不用于工業廢水等污染較為嚴重的廢水的分析，若要使用，必須嚴格按照樣品的前處理方法對樣品進行預處理，使用過程中注意避免氣體、重金屬離子以及有機物進入色譜柱，引起色譜柱喪失部分能力，甚至損壞。
氦離子色譜儀是高效液相色譜的一種，是用來分析陰陽離子的色譜方法下面是氦離子色譜儀在使用前須了解下面這些事項：
1、流動相瓶中濾頭要注意始終處于液面以下，防止將溶液吸干。
2、啟動泵前觀察從流動相瓶到泵之間的管路中是否有氣泡，如果有則應將其排除。
排除方法如下：先將與泵相連的塑料流路接頭擰下來，用洗耳球吸滿去離子水，從與泵段相連的流路管中注入，將流路管中的氣泡排除干凈。然后再將流動相瓶(一般為去離子水瓶)抬高，再將流路接頭與泵連接好。啟動泵，打開泵內排氣閥選鈕，將泵內氣泡排除干凈，一般觀察為流出液比較均勻，再將泵排氣閥擰緊。(注意：此項操作時，整個流路是與色譜柱斷開的)
3、用去離子水或流動相清洗整個流路時，可以采用大流量清洗(一般可將流量設置為2.0ml/min，但不能再太大)以縮短清洗時間，但在通流動相接色譜柱時需要將流量調整為色譜柱使用流量條件。
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