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近日,醫學遺傳學經典期刊Journal of Medical Genetics(Q1區)在線刊表了復旦大學附屬婦產科醫院集愛中心一項研究成果。 該研究通過對多種結構變異檢測技術在隱匿性平衡染色體重排(Balanced Chromosomal Rearrangements, BCRs)的檢測比較,揭示了高分辨率光學基因組圖譜(Optical genome mapping, OGM)在隱匿性染色體重排變異檢測中具有優勢,并推薦可以將OGM作為一種新的檢測隱匿性BCRs的臨床一線手段。
研究背景
染色體重排在多種人類遺傳疾病發生發展中有著深遠的影響,BCRs變異攜帶夫婦發生流產或生育缺陷患兒的風險異常升高。臨床上,根據染色體易位片段大小和易位區帶條帶特征可分為肉眼可見的和隱匿性的BCRs,其中前者可通過常規染色體核型分析明確診斷,而后者卻超出核型分析的檢測能力。當前熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)技術可以診斷BCRs,但前提是需要通過CMA或CNV-seq在攜帶者夫婦流產組織或受累子代中檢測到染色體不平衡重排作為提示,且需要位點特異性熒光探針及中期細胞分裂相培養,所以FISH的臨床應用限制較大。因此,臨床上需要探索一種更加高效、便捷且準確性高的檢測BCRs的新技術方法。
研究路線
研究對象與結果
該研究通過對11對染色體核型正常但有復發流產或受累后代的夫婦進行OGM基因組范圍內的染色體結構變異檢測,在受檢者中檢測到不同類型的染色體重排事件,其中包含隱匿性的相互易位、小片段插入及倒位連接的易位等,同時檢測結果還提示了重排染色體的較精確的斷點區域?;贠GM提示的斷點區域,研究者們通過LR PCR+Sanger測序進一步確定了變異的真實性和精確斷點。此外,研究還通過CMA芯片檢測、CNV-seq和FISH技術證實了變異的準確性。
(受檢者中隱匿性重排的變異詳情)
(OGM變異檢測結果及LR PCR和Sanger測序驗證結果)
(FISH變異驗證結果)
研究結果表明,OGM技術能夠準確檢測到隱匿性BCRs,且可以精準定位出斷裂點所在區帶,結果準確可靠。此外,OGM可以揭示額外的復雜重排事件,能進一步細化相關潛在的遺傳解釋。該研究結果提示OGM在診斷隱匿性BCRs方面具有優勢,可作為臨床常規檢測的一線方法,為BCRs臨床診斷提供了新思路、新視野。
OGM技術簡介
光學基因組圖譜技術(Optical genome mapping, OGM)是一種新型高分辨率細胞遺傳學分析技術,該技術可以利用單個DNA分子基因組限制性內切酶圖譜快速生成高分辨率、有序的全基因組限制性內切酶圖譜,在檢測基因組結構變異的方面具有重大應用價值;這一技術進而可以與現有的高通量測序技術(Next generation sequencing, NGS)相結合,優化涉及遺傳病、腫瘤、血液病等多個領域的檢測流程。
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