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全自動固相萃取儀的特點：一套成熟的自動固相萃取儀應該滿足自動化、模塊化、經濟化、平行化、功能化、擴展化、可靠化這幾個特點。
●自動化：一套完善的自動化固相萃取系統可以真正在無人值守的情況下完成固相萃取方法的應用。有些固相萃取儀僅僅能完成部分固相萃取的步驟，不能成為自動化固相萃取儀。
●模塊化：可以根據不同用戶的應用切換不用的模塊，完成不同固相萃取方法的應用，如雙柱疊加。
●經濟化：一套成熟的全自動固相萃取儀應該給客戶提供經濟化的后期使用體驗。包括試劑、耗材如SPE小柱的選擇。應該可以兼容市售的主流SPE小柱供應商的產品。有些自動化固相萃取儀如賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)旗下的戴安(Dionex)產品，美國吉爾森(Gilson.inc)，Caliper公司的產品能滿足這個要求。
●平行化：使用自動化固相萃取系統的客戶往往希望能夠平行處理，也就是同時處理多個樣品，這種對平行化的要求可以體現在固相萃取的每個步驟，包括小柱活化、上樣、清洗、洗脫。所謂平行處理也就是同時處理，有些儀器如Dionex公司的Autotrace型號在上樣步驟并不能真正的達到平行處理。 但是，在處理大體積樣品時(200mL，甚至500mL以上樣品)，在固相萃取四個步驟中，真正耗費時間的是上樣環節，下表以處理一個樣品為例。可以看到實際處理一個樣品時，上樣時間幾乎占到總時間的94%。Dionex的Auto Trace 280 平衡了萃取效率和儀器成本的綜合因素，提供上樣環節支持*多6通道同時運行，其它步驟(活化、清洗、洗脫)單獨運行的設計。
●功能化：越來越多的實驗室會針對各類樣品進行前處理，包括食品、藥品、農業、環境等相關領域。客戶希望能夠在同一平臺完成常規樣品和大體積樣品的處理。這方面美國吉爾森公司的GX-27X系列產品做的比較好，是能夠在一個平臺完成兩類樣品的自動化固相萃取儀。有些廠家如J2 scientific提供萃取濃縮一體化應用。
●擴展化：擴展性是從軟件和硬件上。從軟件上，擁有一個比較開放、自由的控制軟件能夠給客戶的應用方案提供更多的可行性。從硬件上，實驗室擁有品目繁多的各類實驗用試管及容器，一套成熟的自動固相萃取儀應該能夠給用戶自動自定義管架的功能。就目前而言，只有少數廠家能夠在軟件和硬件上對這個應用提供支持，如美國吉爾森公司。
●可靠化：自動化的儀器*重要的特質就是穩定、可靠。這樣才能發揮自動化的優勢，將實驗中的人為誤差降至*低。而軟件則是其中的重要一環，主流廠商如美國吉爾森公司的產品運用數據庫底核架構的軟件來控制儀器的運行，不但使得軟件更加穩定，而且方便客戶隨時調閱以往實驗的數據記錄。有些廠家往往把各類功能集合在一起，這樣反而由于功能模塊的過多使得故障率偏高，往往一個模塊如濃縮的問題導致整套系統癱瘓，十分影響到客戶的正常應用。
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