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浮游生物自動計數系統內置浮游生物數據庫，通過儀器實現鑒定計數自動化，可以對大河流域和湖泊中水華的發生進行預警，浮游生物自動鑒定計數系統幫助監測工作者提高工作效率與監測水平，為環境監測、水質分析及藻類研究機構提供了良好的操作平臺，從而保障人民飲水安全。
浮游生物自動計數系統的主要性能指標：
1、成像裝置科研級彩色CMOS相機，數據接口：USB3.0，顯微鏡轉接口，三目生物顯微鏡；
2、軟件功能；
1)圖像采集相機連接，白平衡、曝光時間調節，可選擇手動或自動模式拍攝200張圖片三維景深融合超視野拼接；
2)數據庫中文、拉丁文雙語顯示的藻類專家圖庫(共11個門、1569個屬，13085個種)，已有藻類有效圖庫量168179張以上，各圖庫屬種和內容可自行擴充圖庫內單獨分出有毒藻、赤潮藻、水華藻、國內常見淡水藻、國內常見海洋藻中文、拉丁文雙語顯示的浮游動物專家圖庫(共10個大類、1239個屬，4851個種)，已有浮游動物有效圖庫量73928張以上，各圖庫屬種和內容可自行擴充；
3)智能鑒定采用目前先進的深度學習技術自動比對鑒定單圖放大比對多種群圖比對；
4)藻類分類計數采用不同顏色、不同大小的色圈標記各種微藻，按類點擊、自動累積計數優勢種自動排序、按門(類)排序、優勢群落組成百分比分析可自動計算香農-威納指數、均勻性指數、藻密度自動換算、浮游動物豐度自動換算按大量幾何模型來輔助計算生物量；
5)浮游動物分類計數采用不同顏色、不同大小的色圈標記各種微藻，按類點擊、自動累積計數優勢種自動排序、按門(類)排序、優勢群落組成百分比分析；
6)輔助功能單細胞微藻自動計數可測量藻群體面積、浮游生物個體面積，藻類直徑，藻絲、鞭毛長度以及分枝角度歷史計數表記憶功能可在已拍攝的藻細胞圖片上，進行任意的文字、尺寸標注；
7)數據安全及報告多用戶登錄系統，每個賬戶形成獨立數據，數據長久保存統計結果以PDF格式輸出，原始數據不可更改具備審計追蹤功能，操作人員在軟件上的每一步操作軟件自動記錄，以便后續結果數據的追溯自動保存每批顯微照片、統計標識和統計數據。
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