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倒置顯微鏡中常用的觀察方法就是相差。由于這種方法不要求染色，是觀察活細胞和微生物的理想方法。
操作步驟如下：
1、開機，接連電源。打開鏡體下端的電控開關。
2、將待觀察對象置于載物臺上。旋轉三孔轉換器，選擇較小的物鏡。觀察，并調節鉸鏈式雙目目鏡，舒適為宜。
3、調節光源：推拉調節鏡體下端的亮度調節器適宜。通過調節聚光鏡下面的光柵來調節光源的大小。
4、調節像距：轉三孔轉換器，選擇合適倍數的物鏡；更換并選擇合適的目鏡；同時調節升降， 以消除或減小圖像周圍的光暈，提高了圖像的襯度。
5、觀察：通過目鏡進行觀察結果；調整載物臺，選擇觀察視野。
6、關機，取下觀察對象，推拉光源亮度調節器暗。關閉鏡體下端的開關，并斷開電源。旋轉三孔轉換器，使物鏡鏡片置于載物臺下側，防止灰塵的沉降。
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