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氨基酸分析儀是一種分析儀器，采用經典的陽離子交換色譜分離、茚三酮柱后衍生法，對蛋白質水解液及各種游離氨基酸的組分含量進行分析。
1、原理
基于陽離子交換柱分離、柱后茚三酮衍生、光度法測定的離子交換色譜法(IEC)。此類方法由Stein和Moore兩人1958年發明，并于1972年獲諾貝爾獎，是當今標準和國家標準以及仲裁和涉外的方法。
2、重要指標
滿足氨基酸分析儀需要的技術指標如分離度、重復性等要求，而其中的分離度又是更為重要的指標，因為，色譜理論一般以分離度達到1.2作為兩峰基本分離的判定前提，只有峰分開了，才有意義去討論定性和定量的重復性。
3、指標的真實性
有些廠家只標出個別氨基酸的指標或只用平均數據替代全部數據等等，而儀器性能好，經營信譽較高的廠家就會標出全部氨基酸的指標供用戶參考。
4、儀器的可靠性
如果儀器今天堵了、明天漏了，用戶不僅要付出大量人力財力，分析結果的可信度也將大打折扣。
5、儀器的運行成本
例如是否可以使用國產試劑、柱子壽命(以多少次進樣計算、而不以多少年計算)等。
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