無菌均質器叫拍打式均質器，或無菌均質機，工作原理即將原始樣本，與某種液體或溶劑放入均質袋，經本儀器的錘擊板反復在樣品均質袋上錘擊，產生壓力、引起振蕩、加速混合、從而達到溶液中微生物成分處于均勻分布狀態，主要用于從固體樣品中提取細菌的過程，只需將樣品和稀釋液加入到無菌的樣品袋中，然后將樣品袋放入拍擊式均質器中即可完成樣品的處理，有效地分離被包含在固體樣品內部和表面的微生物均一樣品，確保無菌袋中混合全部的樣品。處理后的樣品溶液可以直接進行取樣和分析，沒有樣品的變化和交叉污染的危險。

無菌均質器適用于腦、腎、肝、脾等動物組織及微生物的均質處理、化妝品的均質處理，特別適合于微生物檢測樣本的制備，樣品無污染、無損傷、不升溫、不需要滅菌處理，不需洗刷器皿的特點。無菌均質器在均質過程中，解脂酶活化，脂肪球表面積增加，會加快脂肪的解脂酸敗，均質對蛋白質的影響表現在使酪蛋白膠粒變小，乳漿中一些蛋白質移到脂肪球上，補充增大了脂肪球表面積。由于均質前預熱、高壓等原因，使一些蛋白質變性，會降低蛋白質的穩定性。均質處理乳，凝乳酶作用形成凝乳質地較軟，保水能力較大，脂肪球和酶蛋白膠粒變小，表面積增大，有利于消化酶作用。消化率、吸收率、蛋白質利用率都會增加，已廣泛應用于食品、藥品、臨床、分子學、毒素及細菌檢測等領域。