1. 感染預實驗
以 24 孔培養(yǎng)板為例,同時進行目的細胞和工具細胞的感染預實驗。工具細胞可選擇 293T(人胚腎上皮細胞)、H1299(人肺癌細胞)或其它細胞。實驗材料:培養(yǎng)基、24 孔培養(yǎng)板,移液槍,槍頭, EP 管,細胞計數(shù)板、冰盒、廢液缸等。(根據(jù)目的細胞情況,可酌情使用 Polybrene)
Day1:
準備細胞:培養(yǎng)細胞至對數(shù)生長期,細胞以胰酶消化計數(shù)后,用細胞計數(shù)測出細胞密度,每孔接種 5×104 個細胞,添加細胞培養(yǎng)液至 500µL。通常情況下,該接種量的 H1299 或 293T 細胞在感染后第 3 天可生長至 80%-90% 融合度。(接種目的細胞時,請根據(jù)細胞的實際生長速度調(diào)整接種量,使目的細胞感染后第 3 天生長至 80%-90% 融合度)
Day2:
(1)準備慢病毒顆粒:計算所需慢病毒顆粒的量,將凍存在 -80℃ 的慢病毒顆粒取出,冰浴融化;
(2)感染目的細胞:從培養(yǎng)箱中拿出細胞,置于顯微鏡下觀察細胞生長狀態(tài)及細胞融合度;如細胞狀態(tài)較好,則開始實驗:
A. 用移液槍小心吸去 24 孔板中的舊培養(yǎng)液,加入新的*培養(yǎng)液;
B. 在細胞中分別加入計算好的慢病毒顆粒液,將培養(yǎng)板平置于工作臺上,以劃 8 字的方式輕柔混勻;
C. 混勻后,細胞培養(yǎng)板置于 37℃、5% CO2 培養(yǎng)箱,過夜培養(yǎng)。
Day3:
更換培養(yǎng)液:感染 12-16 小時后,吸出含慢病毒顆粒的培養(yǎng)液,重新向培養(yǎng)板添加含 5% 滅活 FBS(胎牛血清)的培養(yǎng)液,繼續(xù)培養(yǎng)。(目的細胞需要調(diào)整感染時長,部分細胞不可感染超過 12 小時。)
Day4:
繼續(xù)培養(yǎng)細胞,觀察細胞狀態(tài)是否有異常。
Day5:
觀察(評估)慢病毒顆粒感染效率:蓋緊 24 孔培養(yǎng)板,使用 70% 乙醇清理培養(yǎng)板外壁,在倒置熒光顯微鏡觀察熒光,拍照并估計慢病毒顆粒對細胞的感染效率。(如果慢病毒顆粒攜帶的基因表達所需的時間較長,熒光表達所需時間也較長,建議感染 72、96 小時后觀測熒光表達。)
根據(jù)熒光情況,可以初步從 MOI 梯度摸索實驗中,找出目的細胞的 MOI 值。
圖 1. H1299 細胞的 MOI 梯度摸索結(jié)果示例
示例中使用的慢病毒顆粒是 LPP-eGFP-Lv105(滴度 1×10 8TU/mL),曝光時間 1s,顯微倍數(shù) 100×。從上圖可見第 2 組細胞的感染效率已達到 90%。由于慢病毒顆粒對細胞有一定毒性,當 MOI 值過高時,繼續(xù)添加慢病毒顆粒,感染效率沒有明顯增加,且細胞狀態(tài)容易變差、皺縮甚至死亡。
熒光報告基因和目的基因的相對表達并不總是成等比關(guān)系的。在有的情況下,即使熒光報告基因表達較低或無表達,目的基因依然能夠表達;反之亦然。所以在觀察熒光效果后,建議使用 qRT-PCR 作進一步鑒定。
圖 2. 293T 細胞的 MOI 梯度摸索結(jié)果示例
示例中使用的慢病毒顆粒是 LPP-eGFP-Lv105(滴度 1×108TU/mL),曝光時間 0.6s,顯微倍數(shù) 100×。從上圖可見第 2 組細胞的感染效率已達到 80%。由于慢病毒顆粒對細胞有一定毒性,當 MOI 值過高時,繼續(xù)添加慢病毒顆粒,感染效率沒有明顯增加,且細胞狀態(tài)容易變差、皺縮甚至死亡。
2. 摸索細胞的zui適藥物篩選濃度
細胞的種類與狀態(tài)均會影響慢病毒顆粒轉(zhuǎn)導效率,部分細胞可能與慢病毒顆粒有相互抵抗的現(xiàn)象,導致感染效率低。當您在感染后 72、96 小時后發(fā)現(xiàn)感染效果仍不理想,建議對感染后的細胞進行藥物篩選(藥篩),以收集較多感染成功的細胞。
慢病毒顆粒攜帶的基因整合到目的細胞基因組是隨機發(fā)生的非同源性重組,當抗性基因表達時,目的基因不一定也能表達,在進行藥篩處理后,還要以 qRT-PCR 作進一步鑒定。
在進行正式的抗生素篩選前,建議您先對空白細胞的zui小致死濃度進行摸索、優(yōu)化。
表 4. 抗生素篩選細胞的相關(guān)參考值
以 293T 細胞+Puromycin 為例,從相關(guān)文獻查得 Puromycin 對 293T 細胞的zui小致死濃度為 2 µg/mL。在 2 µg/mL 附件多設(shè)置幾個濃度梯度,可以得出較的的篩選濃度。
(1)準備 24 孔培養(yǎng)板,按每孔 1-5×104 細胞數(shù) (約等于 20%-35% 融合度) 接種 293T 空白細胞,對其中 6 個孔進行鋪板;
(2)一般 Puromycin 母液的濃度是 10 mg/mL,用細胞培養(yǎng)基將 Puromycin 母液稀釋 1000 倍,可獲得終濃度為 10 µg/mL 的 Puromycin 稀釋液;
(3)按表 5 所示,每孔添加相應(yīng)的細胞培養(yǎng)基和 Puromycin;
(4)24 孔培養(yǎng)板置于 37℃、5% CO2 培養(yǎng)箱,培養(yǎng)過夜;
(5)按表 4 的藥篩時間和觀察時間建議,定期在熒光顯微鏡下觀察細胞狀態(tài)。
當空白細胞剛好能全部死亡時,該濃度的抗生素可作為zui適藥篩濃度。
表 5. 藥物篩選濃度梯度參考(Puromycin)
* 表格中使用的 Puromycin 濃度為 10 µg/mL,是由 10 mg/mL 的 Puromycin 母液以細胞培養(yǎng)液稀釋 1000 倍所得。
注:以上表格的設(shè)置僅供參考。通常即使細胞一樣,由于培養(yǎng)的條件和傳代次數(shù)不一樣,篩選濃度亦不一樣。可根據(jù)試驗結(jié)果進行更進一步的細化濃度梯度設(shè)置。 如果藥篩過程中細胞量較少,為保持細胞的數(shù)一定,一般不換液,只有在穩(wěn)轉(zhuǎn)株藥篩過程中,根據(jù)細胞生長速度,3-4 天換液一次。
如果目的細胞較難感染,一次感染不能達到預期效果時,在感染 3 天后可對目的細胞進行藥篩處理,獲得較多被感染的細胞,如以下例子所示:
圖 3. 人食管癌細胞 CE-81T(貼壁細胞)的藥篩前后效果對比
圖 4. 人骨肉瘤細胞 Hos(貼壁細胞)的藥篩前后效果對比
圖 5. 人白血病 K562(懸浮細胞)的藥篩前后效果對比
附:細胞融合度參考
圖 6. 293T 細胞在不同融合度的明視野效果(放大倍數(shù):100×)
3. 實驗體系的放大和正式實驗
根據(jù)預實驗結(jié)果,放大慢病毒顆粒細胞感染實驗,實施正式實驗。
通過慢病毒顆粒感染細胞的預實驗,我們大致獲得慢病毒顆粒感染目的細胞的優(yōu)化條件。正式實驗所用的細胞數(shù)往往比預實驗多,慢病毒顆粒用量也需要適當放大。放大原則是保持細胞密度一致,按實際細胞數(shù)與預實驗細胞數(shù)的比例放大培養(yǎng)液體積和慢病毒顆粒用量。有兩種放大方法可供參考:
按底面積放大(適用于貼壁細胞)
當細胞的密度不變時,細胞總數(shù)和底面積成正比,且 MOI 不變,所需慢病毒顆粒用量也和底面積成正比。假設(shè)預實驗使用 96 孔板(底面積 0.3 cm2),使用 1 μL 慢病毒顆粒(滴度 1×108 TU/mL)可成功感染細胞;如正式實驗使用 6 孔板(底面積 10 cm2),則:
底面積的放大倍數(shù) ≈ 33
正式的慢病毒顆粒用量 = 預實驗用量×33 = 33 μL 慢病毒顆粒(滴度 1×108 TU/mL)
注:請確保細胞均勻、單層分布,不成簇生長。
按培養(yǎng)體積放大(適用于懸浮細胞)
當細胞的密度不變時,細胞總數(shù)和感染體積成正比,且 MOI 不變,所需慢病毒顆粒用量也和培養(yǎng)液體積成正比。假設(shè)預實驗使用 96 孔板(培養(yǎng)體積 100μL),使用 1 μL 慢病毒(滴度 1×108 TU/mL)可成功感染細胞;如正式實驗使用 6 孔板(培養(yǎng)體積 2 mL),則:
培養(yǎng)體積的放大倍數(shù) = 20
正式的慢病毒顆粒用量 = 預實驗用量×20 = 20 μL 慢病毒顆粒(滴度 1×108 TU/mL)
注:請確保細胞生長狀態(tài)良好。
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