全轉錄組測序實驗概述

全轉錄組測序（Whole Transcriptome Sequencing, WTS）是一種高通量測序技術，旨在全面分析特定細胞或組織在某一功能狀態下所有轉錄產物的集合，包括信使RNA（mRNA）、長非編碼RNA（lncRNA）、環狀RNA（circRNA）以及微小RNA（miRNA）等。這項技術能夠揭示基因轉錄本的多樣性和復雜性，對于研究基因表達調控、非編碼RNA的功能、細胞信號傳導、基因功能鑒定、新發現基因、發育生物學、疾病機制、藥物治療以及微生物組學等領域具有重要意義。

全轉錄組測序實驗的技術流程

全轉錄組測序的技術流程通常包括樣本處理、RNA提取、文庫構建和高通量測序。文庫構建分為小RNA文庫和去除核糖體的鏈特異性文庫，分別針對不同長度和類型的RNA分子進行優化處理。測序后，通過生物信息學分析，研究者可以獲得關于不同RNA分子的序列信息、表達水平、剪接變體、調控網絡等多方面的數據。

全轉錄組測序的應用

全轉錄組測序在臨床醫學中的應用日益增多，它可以用于病原體檢測、疾病相關基因變異的識別、藥物療效評估和預后分析等。此外，全轉錄組測序還能夠幫助科學家們在單細胞層面上研究細胞異質性和動態變化，為個性化醫療和精準治療提供數據支持。

最新研究進展

近期的研究進展顯示，全轉錄組測序技術正在向著更高的空間分辨率和臨床應用方向發展。例如，耶魯大學樊榮團隊報道了全球shou個臨床級福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）樣本空間全轉錄組測序技術——Patho-DBiT，該技術能夠實現對FFPE復雜組織中豐富的RNA生物學信息的空間解碼，包括單細胞級mRNA圖譜、非編碼RNA表達、可變剪接、遺傳變異等。此外，還有研究開發了新的單細胞全轉錄組測序方法scFAST-seq，該方法能夠高效捕獲mRNA和不帶有poly-A尾的RNA，如lncRNA，并結合target region enrichment技術檢測單細胞水平的基因突變和基因融合。

這些最新的研究成果不僅推動了全轉錄組測序技術的發展，也為未來在生物醫學研究和臨床診斷中的應用打開了新的可能性。