細胞凋亡可以用TNNEL法檢測，TUNEL(TdT-mediated DUTP nick end labeling)細胞凋亡檢測試劑盒是用來檢測組織細胞在凋亡早期過程中細胞核DNA的斷裂情況。其原理是熒光素（fluorescein）標記的dUTP在脫氧核糖核苷酸末端轉移酶（TdT Enzyme）的作用下，可以連接到凋亡細胞中斷裂DNA的3’-OH末端，并與連接辣根過氧化物酶（HRP，horse-radish peroxidase）的熒光素抗體特異性結合，后者又與HRP第五二氨基聯苯胺（DAB）反應產生很強的顏色反應（呈深棕色），特異準確地定位正在凋亡的細胞，因而在光學顯微鏡下即可觀察凋亡細胞。由于正常的或正在增值的細胞幾乎沒有DNA斷裂，因而沒有3’-OH形成，很少能夠被染色。TUNEL細胞凋亡試劑盒適用于組織樣本（石蠟包埋、冰凍和超薄切片）和細胞樣本（細胞涂片）在單細胞水平上的凋亡原位檢測。