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賽默飛熒光定量pcr儀使用方法

2024-12-25  閱讀(199)

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賽默飛熒光定量PCR儀使用方法

賽默飛熒光定量PCR儀(如 QuantStudio 系列、ABI 7500 系列)廣泛用于基因表達分析、病原體檢測、基因分型等實驗。以下是熒光定量PCR儀的標準操作方法,幫助您完成實驗。


1. 儀器操作前的準備

實驗設計

  1. 確定實驗目標:

    • 基因表達定量、病原體檢測、SNP分析等。

  2. 選擇合適的試劑體系:

    • 使用 TaqMan 探針、SYBR Green 染料或其他符合實驗需求的反應體系。

實驗材料準備

  • 樣本模板(如 DNA、RNA 經過反轉錄的 cDNA)。

  • 引物和探針(設計特異性高的引物和探針)。

  • PCR 反應試劑(如 Taq 酶、dNTPs)。

  • PCR 反應板(96孔或384孔,依儀器型號選擇)或 PCR 管。

  • 無菌操作工具(如移液器、濾芯吸頭)。

檢查儀器狀態

  • 確保熒光定量PCR儀已正確連接電源并開機。

  • 檢查儀器是否校準,包括光學通道和溫控模塊。

  • 清潔樣本托盤,避免污染。


2. 樣本和反應混合物的制備

標準 PCR 反應體系(以 20 µL 反應體系為例):

成分體積(µL)說明
樣本模板1-2根據實驗需求調整濃度和體積
引物對(10 µM)0.4-1.0每對引物(正向和反向)
探針或染料0.5如 TaqMan 探針或 SYBR Green 染料
PCR 反應緩沖液10含 Mg2?、dNTPs 等
Taq DNA 聚合酶0.5熱穩定酶,支持實時擴增
無核酸酶水調至總量 20 µL確保反應體系最終體積正確

步驟:

  1. 在無菌環境下混合所有反應成分,輕輕振蕩均勻,避免氣泡產生。

  2. 將混合好的反應液分裝至 96 孔 PCR 板或 0.2 mL PCR 管中。

  3. 在每個孔/管上覆蓋光學透明封板或封膜,防止蒸發。

  4. 確保每孔的體積一致,以避免離心過程中不平衡。


3. 熒光定量PCR儀操作步驟

1. 啟動儀器

  • 按儀器型號啟動,如 QuantStudio 系列或 ABI 7500 系列。

  • 打開儀器配套軟件(如 QuantStudio Design and Analysis 軟件)。

2. 設置實驗參數

  1. 選擇實驗類型:

    • 絕對定量實驗:檢測樣本中靶基因的絕對拷貝數。

    • 相對定量實驗:研究靶基因在不同樣本中的表達水平。

    • 溶解曲線分析:用于區分特異性擴增和非特異性擴增產物。

  2. 輸入實驗設計:

    • 輸入靶基因和對照基因的信息。

    • 熒光染料/探針類型(如 FAM、SYBR Green)。

  3. 選擇樣本板格式:

    • 根據實驗需要選擇 96 孔板或 384 孔板。

    • 設置每個孔的樣本名稱、反應成分和靶標信息。

  4. 設置 PCR 程序:

    • 初始變性: 95°C,2 分鐘。

    • 循環反應:

    • 95°C,15 秒(變性)。

    • 60°C,30-60 秒(退火和延伸),共 40-45 個循環。

    • 標準熱循環程序:

    • 如果是溶解曲線分析,加入升溫梯度(如從 60°C 升至 95°C)。

3. 加載樣本板

  • 將已封裝好的 PCR 板或 PCR 管放入儀器樣本托盤。

  • 確保板的擺放位置正確,并關閉樣本艙門。

4. 啟動運行

  • 點擊軟件中的 "運行" 按鈕,啟動實驗程序。

  • 儀器開始熱循環過程,同時采集熒光信號。


4. 數據分析和結果處理

1. 實時監測

  • 儀器運行期間,可實時觀察熒光信號累積曲線,監控樣本擴增狀態。

2. 結果分析

  • 擴增曲線:分析每個樣本的熒光信號累積曲線,判斷 Ct 值(循環閾值)。

  • Ct 值分析:

    • 定量分析靶標的表達水平。

    • 樣本濃度越高,Ct 值越低。

  • 溶解曲線(SYBR Green 實驗):判斷擴增產物的特異性。

  • 標準曲線分析(絕對定量實驗):根據標準品濃度繪制標準曲線,計算樣本濃度。

3. 數據導出

  • 實驗完成后,通過軟件導出實驗數據(如擴增曲線圖、Ct 值表)。

  • 數據可保存為 Excel、PDF 或其他格式,方便后續分析。


5. 儀器清潔與維護

  1. 樣本艙清潔:

    • 每次實驗后,用無塵布輕輕擦拭樣本托盤,去除可能的污染物。

    • 定期清潔光學模塊(如說明書所示),確保熒光檢測靈敏度。

  2. 軟件維護:

    • 定期更新儀器和軟件至最新版本,獲取最新功能和性能優化。

  3. 校準與檢測:

    • 定期校準儀器光學系統和溫控模塊,確保數據準確性。

    • 如果儀器長期未使用,建議在正式實驗前進行性能驗證。

  4. 安全存儲:

    • 關閉儀器電源,保持設備干燥。

    • 防止樣本托盤接觸過高濕度或灰塵。


注意事項

  1. 樣本準備階段:

    • 嚴格避免交叉污染。

    • 使用無 RNA 酶、無 DNA 酶的耗材。

    • 模板樣本濃度適中,過高會導致抑制擴增。

  2. 反應體系配置:

    • 所有操作在冰上進行,防止酶降解。

    • 確保所有反應組分混合均勻。

  3. 實驗運行階段:

    • 不要隨意中斷儀器運行,避免影響實驗數據。

    • 保證實驗室環境穩定,避免震動或電力波動。


總結

賽默飛熒光定量PCR儀的使用主要包括 樣本準備、反應體系配置、儀器參數設置、運行程序以及數據分析 等五個核心環節。嚴格按照操作規范可以有效提高實驗的成功率和數據的可靠性。實驗完成后,定期維護儀器可確保其長期穩定運行。


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