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如何操作賽默飛熒光定量PCR儀

2025-3-24　　閱讀(108)

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操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按照一系列步驟來配置設(shè)備、設(shè)置實驗程序、運行實驗和分析數(shù)據(jù)。以下是詳細(xì)的操作步驟和注意事項，幫助您順利完成實驗。

一、準(zhǔn)備工作

在正式操作賽默飛熒光定量PCR儀前，請確保以下準(zhǔn)備工作已完成：

  1. 檢查儀器狀態(tài)：

    • 確保儀器已連接電源并啟動。

    • 檢查熱蓋和樣品架，確保它們安裝牢固并處于正常工作狀態(tài)。

  2. 檢查反應(yīng)體系：

    • 準(zhǔn)備好PCR反應(yīng)體系，包括模板、引物、酶、熒光染料等。

    • 準(zhǔn)備好所需的樣品（如DNA、RNA模板），并檢查其濃度。

  3. 確保計算機和儀器連接正常：

    • 確保儀器與控制計算機或觸摸屏之間的連接正常，可以順利打開實驗軟件。

二、創(chuàng)建實驗程序

  1. 打開儀器：

    • 按下設(shè)備的開機按鈕，啟動儀器。儀器啟動后，屏幕會顯示歡迎界面。

    • 如果儀器已配備觸摸屏界面，直接通過觸摸屏操作。

  2. 進入實驗設(shè)置界面：

    • 在儀器軟件的主界面上，選擇“新建實驗"或“新建程序"選項，以創(chuàng)建新的實驗程序。

  3. 輸入實驗信息：

    • 在創(chuàng)建新實驗時，首先需要輸入實驗名稱、實驗描述、樣本信息（如目標(biāo)基因、引物等）等相關(guān)信息。

    • 選擇PCR類型：通常選擇“熒光定量PCR"。

    • 選擇引物類型：如果使用SYBR Green、TaqMan或其他探針，進行相應(yīng)選擇。

  4. 設(shè)置反應(yīng)體系：

    • 反應(yīng)體積：根據(jù)實驗需求設(shè)置反應(yīng)體積（常見體積有20 μL、25 μL、50 μL等）。

    • 樣品信息：輸入樣品類型和濃度信息。確保樣品濃度與反應(yīng)體系相匹配。

    • 引物/探針選擇：輸入或選擇所使用的引物和探針信息。確保熒光探針的選擇正確，并且與所用的熒光染料兼容。

三、設(shè)置熱循環(huán)條件

  1. 設(shè)置溫度和時間：

    • 變性溫度：通常設(shè)置在94-98°C之間。

    • 退火溫度：根據(jù)引物的Tm值，通常設(shè)置在50-65°C之間。

    • 擴增溫度：一般設(shè)置為72°C（適用于大多數(shù)DNA聚合酶）。

    • 延伸時間：根據(jù)PCR產(chǎn)物的長度設(shè)定，通常設(shè)置為每千堿基15秒。

  2. 設(shè)置循環(huán)次數(shù)：

    • 設(shè)置PCR循環(huán)次數(shù)，通常為40次，但根據(jù)樣品特性可以適當(dāng)調(diào)整。

  3. 熔解曲線分析（可選）：

    • 如果需要進行特異性檢測，可以在最后一步啟用熔解曲線分析。熔解曲線可以幫助檢測PCR產(chǎn)物的特異性，避免非特異性擴增。

四、選擇熒光檢測通道

  1. 選擇適當(dāng)?shù)臒晒馊玖?/strong>：

    • 如果使用單一染料（如SYBR Green），選擇對應(yīng)的檢測通道。

    • 如果使用多種熒光染料（如TaqMan探針），選擇多個通道進行多重檢測。

  2. 設(shè)置熒光信號采集時間點：

    • 在每個擴增周期的合適位置采集熒光信號。通常選擇在擴增的末期進行熒光信號采集。

五、啟動實驗

  1. 檢查所有設(shè)置：

    • 在開始實驗之前，確保所有設(shè)置無誤，檢查反應(yīng)體系、溫度條件、循環(huán)次數(shù)和熒光探針設(shè)置等。

    • 如果一切正常，點擊“開始實驗"按鈕啟動PCR反應(yīng)。

  2. 儀器運行：

    • 儀器會自動完成熱循環(huán)過程，同時通過熒光檢測系統(tǒng)監(jiān)測反應(yīng)中的熒光信號變化。

    • 實驗過程可以實時查看圖表、溫度、熒光信號等數(shù)據(jù)。

六、數(shù)據(jù)分析

  1. 實驗完成后查看數(shù)據(jù)：

    • 實驗結(jié)束后，儀器會生成實時定量PCR結(jié)果，包括Ct值、熒光信號變化曲線等。

    • 點擊“數(shù)據(jù)分析"進入數(shù)據(jù)分析界面，可以選擇查看熒光信號曲線、標(biāo)準(zhǔn)曲線、Ct值等。

  2. 數(shù)據(jù)分析選項：

    • Ct值分析：根據(jù)熒光信號的變化，自動計算各樣本的Ct值，并進行基因定量。

    • 標(biāo)準(zhǔn)曲線分析：如果需要定量分析樣本的濃度，可以通過標(biāo)準(zhǔn)曲線法進行分析。

    • 熔解曲線分析：對PCR產(chǎn)物進行熔解曲線分析，檢查擴增產(chǎn)物的特異性。

  3. 導(dǎo)出數(shù)據(jù)：

    • 在數(shù)據(jù)分析完成后，用戶可以將分析結(jié)果導(dǎo)出為Excel、PDF等格式，便于進一步分析或報告書寫。

七、實驗結(jié)束后的注意事項

  1. 清潔儀器：

    • 每次實驗結(jié)束后，清理PCR儀的樣品架和反應(yīng)管，防止樣品污染。

    • 定期清潔儀器表面和熱蓋，避免熒光信號的干擾。

  2. 保存實驗數(shù)據(jù)：

    • 確保保存實驗數(shù)據(jù)和程序設(shè)置，避免數(shù)據(jù)丟失?？梢詫?shù)據(jù)保存在云端或外部存儲設(shè)備上。

  3. 檢查儀器運行狀態(tài)：

    • 定期檢查儀器的運行狀況，包括校準(zhǔn)、溫控系統(tǒng)、熒光檢測系統(tǒng)等，確保儀器處于最佳工作狀態(tài)。

八、常見問題及解決方法

  1. 信號過低或過高：

    • 可能原因：模板濃度不適、引物濃度不合適、反應(yīng)體系配制不當(dāng)。

    • 解決方法：適當(dāng)調(diào)整模板濃度和引物濃度，確保反應(yīng)體系的準(zhǔn)確性。

  2. 非特異性擴增：

    • 可能原因：引物設(shè)計問題、退火溫度設(shè)置不當(dāng)。

    • 解決方法：優(yōu)化引物設(shè)計、調(diào)整退火溫度，確保擴增特異性。

  3. 實驗反應(yīng)失敗：

    • 可能原因：反應(yīng)體系準(zhǔn)備不充分或試劑過期。

    • 解決方法：檢查試劑是否過期，確保所有試劑的新鮮度并準(zhǔn)確配制反應(yīng)體系。

總結(jié)

操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按步驟配置實驗程序、設(shè)置反應(yīng)體系、選擇合適的熱循環(huán)條件和熒光探針通道。儀器的智能化設(shè)計使得操作相對簡便，但仍然需要細(xì)致地檢查設(shè)置和反應(yīng)體系，確保實驗的順利進行。通過合理設(shè)置和分析，您可以得到高質(zhì)量的定量PCR結(jié)果。


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