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在氣相色譜儀分析中，實驗人員總希望有一種進樣系統既能適應填充柱和毛細管柱，又能滿足不同進樣量和進樣技術的需要，實踐證明這是不可現實的。

因此，開展一項新的氣相色譜分析任務，面臨選擇進樣系統的問題時。該選哪種進樣系統主要是根據樣品性質、分析目的和色譜柱類型等來決定。

原則如下：在滿足氣相色譜分析要求的前提下，盡量選用結構簡單、操作和維修方便的進樣系統。如填充柱和毛細管柱進樣系統均可，優選前者；毛細管柱常規分析時分流進樣系統為優選等。

無論采用什么色譜分析方法，毛細管柱容量和載氣流量與填充柱相比都較低，雖然根據毛細管柱分析特點，設計了多種進樣系統，改進了進樣技術，但進樣引起的定量誤差總體來說比填充柱進樣大。

因此，毛細管柱進樣系統的選擇比填充柱考慮的因素多。從理論上講某一個樣品可能有多種進樣系統可供選擇，但實際上在性價比、操作簡便性和維修保養要求等方面可能存在很大不同。選擇進樣系統時，應先列出不同進樣系統的優缺點，經比較后再最終確定。