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大腸桿菌折戟沉沙,誰來拯救包涵體蛋白?

閱讀:247      發布時間:2024-7-16
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哈嘍寶子們,我最近遇到了一個難纏的蛋白,用大腸桿菌表達后會出現在沉淀中。如果從沉淀中提取純化,操作復雜姑且不論,還有可能沒有活性!如果優化培養條件讓它在上清中表達,需要慢慢摸索,費時費力還不一定成功。這幾天為了思考解決辦法,真是要茶飯不思了!

閉門造車不如出門取經,這不,我在萬能的師兄這里求來了一樣新“法寶",據說它可以讓包涵體蛋白在上清中表達。今天讓我們一起來看一下它究竟“威能"如何吧!內含我的真實實驗步驟+結果+操作Tips哦。


如何拯救包涵體蛋白?


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“法寶"顯威——無細胞蛋白表達試劑盒初體驗



一、使用前準備


打開試劑盒,讓我們看一下它的廬山真面目。

試劑盒內一共三個組分,分別是:

組分A、組分B、PC(陽性對照質粒)。

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將各組分取出,在冰上融化。

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二、模板準備


與原核細胞表達不同,這款無細胞試劑盒可以不用質粒模板,只需要在目的基因上下游引入T7轉錄表達原件,構建一個線性模板。

第一步,用PCR分別獲得5UTR片段,3UTR片段以及目的基因片段;

第二步,用重疊PCR方法,將上一步獲得的目的基因片段和5UTR片段,3UTR片段拼接稱完整的線性表達模板。

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三、體系構建


由于是初次嘗試,我這次選擇50μL的總體積。在96孔板中反應,按照這張表加試劑和構建好的DNA模板5μL(體系體積的1/10),用移液槍反復吹打混勻。


試劑

陰性對照(μL

陽性對照(μL

實驗組(μL

組分A

20.5

20.5

20.5

組分B

16.7

16.7

16.7

DNA模板

/

5

5

雙蒸水

12.8

7.8

7.8

反應總體積

50

50

50


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四、孵育


將混合好的反應液轉移至搖床中,溫度25℃、180rpm,反應16h,確保蛋白表達。


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孵育四小時后,迫不及待先看一下GFP的表達情況,觀察到陽性對照已有明顯綠色熒光。

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五、收獲


次日一早,打開搖床就看到了陽性對照醒目的綠色熒光。既然陽性對照表達了,目標蛋白想來不成問題!滿懷期待開始離心、跑膠鑒定。


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六、鑒定


將陰性對照和實驗組分別制洗脫樣、上清樣、沉淀樣,上樣量:洗脫樣、上清樣10μL,沉淀樣5μL。電泳條件:12%SDS-PAGE膠,100V,1.5h。

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不愧是師兄力薦的“法寶",沒有辜負我的厚望,第一次實驗,我的蛋白就在上清中成功表達了!


七、總結

這次實驗真是一次全新的體驗。在無細胞蛋白表達體系下,整個實驗從模板構建、反應體系構建、孵育、到最后收獲目標蛋白并鑒定,只用了兩天時間,不但在上清中表達出了原核細胞表達中會形成包涵體的蛋白,還大大縮短了實驗時間。真讓我有把所有蛋白都用無細胞體系表達的沖動!

Tips:


1.無細胞蛋白表達試劑盒可以用線性模板也可以用質粒模板,線性模板更加方便快捷,但是質粒模板表達量一般較高。

2.組分A、B在實驗前要提前放在冰上融化,防止試劑失效。使用前先用移液槍吹打混勻,再吸取相應體積。

3.微孔板四周可以加入適量雙蒸水,防止孵育過程中體系水分蒸發。本次實驗因為要過夜表達,為了確保反應體系不被蒸干,我在96孔板最外側一周的所有孔位里都加了水,而且在搖床四角也各放置了一只裝水的離心管。

4.對于復雜蛋白表達,可以延長孵育時間,保證蛋白充分表達。

5.如果調整反應體積,需要按照說明書推薦隨之調整反應容器。


CFPS——蛋白表達“新勢力"


初次表達包涵體大獲成功,無細胞蛋白表達究竟是“何方神圣"?在實驗結束之后,我粗略了解了一下這一新技術,發現它的強大不止于此。

無細胞蛋白表達(Cell-free protein expression,CFPS)是指將細胞內合成蛋白所需要的RNA聚合酶、核糖體及轉錄翻譯輔助因子等分子機器提取出來,并輔以核苷酸、氨基酸、能量物質及基因模板,在沒有活細胞參與的體外直接合成蛋白質的生物合成反應。

受細胞自身生理功能限制,有些蛋白在傳統的細胞表達系統產量低甚至不能表達,而無細胞系統可以擺脫這種限制,廣泛適用于細胞因子、抗體、膜蛋白、毒性蛋白、包涵體蛋白表達等場景。此外,無細胞蛋白表達反應周期短、易與自動化設備結合、自由度與可控程度高,適合蛋白快速交付、酶定向進化篩選、AI蛋白制造、ADC藥物開發等領域,可謂是蛋白表達領域的“新勢力"。

隨著合成生物學發展,無細胞蛋白表達技術已然嶄露頭角,大有騰飛之勢。技術的發展是推動科學研究進步的重要助力,善于利用新技術,有時能使科研過程事半功倍,我也算是深有體會了!



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