分子生物學(基因工程)的實驗中,經常要做細胞質粒DNA的提取和檢測工作,以便獲得運載基因的載體DNA;或用于實行電泳檢測分析,了解樣品是否含有質粒DNA(包括重組質粒DNA),判斷其分子量大小,區別不同質粒等等。因此質粒DNA的提取是基因工程實驗中zui常用的手段之一。
質粒是一種染色體外的穩定遺傳銀子,大小從1kb到200kb不等,大多數來自細菌的質粒是雙鏈、共價閉合環狀的分子,并以超螺旋形式存在于宿主的細胞質中。它是細菌內的共生型遺傳因子,主要發現于細菌、放線菌和真菌細胞中,質粒具有自主復制和轉錄能力,能在子代細胞中保持恒定的拷貝數,并表達所攜帶的遺傳信息。
質粒的分離是利用質粒DNA和染色體DNA在變性與復性中的差異來達到的目的。當菌體在NaOH和SDS溶液中裂解時,蛋白質與DNA發生變性,由于染色體DNA與質粒DNA拓撲構型不同,染色體DNA雙螺旋結構解開,而共價閉合質粒DNA的氫鍵雖被斷裂,但兩條互補鏈彼此相互盤繞仍會緊密地結合在儀器。當加入中和液后,溶液pH恢復至中性,在高鹽濃度的情況下,染色體DNA之間交聯形成不溶性網狀結構并與蛋白質SDS復合物等形成沉淀;不同的是質粒DNA復性迅速而準確,保持可溶狀態而留在上清中。這樣,通過離心可沉淀大部分細胞碎片、染色體DNA、RNA及蛋白質。除去沉淀后上清中的質粒可用酚氯仿抽提進一步純化質粒DNA。
前面提取質粒DNA的方法就是實驗室常用的堿裂解法,該法的操作過程如下:首先講含有質粒的細菌接種到培養基,經過大約12小時的恒溫搖陪后棄去上清液,加入中和液后用漩渦混勻器將溶液充分混勻,然后加入堿液進行沉淀,這就是變性與復性,zui后的操作就是實驗室常用的沉淀的分離、純化。分離、純化DNA首先取上清液,加入分離液后采用漩渦混勻器混勻溶液,離心取上清液,加入無水乙醇后混勻,離心后棄上清液,干燥DNA即可。
這個實驗中常用到漩渦混勻器進行溶液混勻,意大利VELP公司推出多種型號的漩渦混勻器可滿足每一個實驗室的需要和安全標準。特別是紅外漩渦混勻器,這是VELP公司的,該漩渦混勻器一旦檢測到試管即自動開始震動混勻,不需要施加任何外力,震動速度可調,時間可設,漩渦混勻器穩定性高,非常適合細胞質粒提取實驗。
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