當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>>蛋白分析>> SWATH定量蛋白組學服務檢測技術服務
SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)由ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold團隊與AB SCIEX共同研發的一項全新的質譜采集模式技術。SWATH作為一種DIA (Data Independent Acquisition)技術,將整個質譜掃描質量范圍分為若干小窗口,依次對每個窗口的所有離子進行碎裂,使其能夠對掃描區間內的所有肽段離子進行高速一級MS掃描再進行二級MS/MS分析。因此,SWATH能夠對復雜樣品中幾乎所有可檢測的分子進行定量測定。SWATH綜合了shotgun proteomics高通量檢測的特點與jīngzhǔn定量分析的優勢,是真正意義上的全景質譜檢測手段MS/MS ALL。 百泰派克公司采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨質譜系統,具有快速掃描速度和串聯四極桿質譜系統的定量靈敏度能力,集質譜系統的高分辨、準確質量數穩定性、高靈敏度和高速度掃描特點于一身,推出SWATH定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的樣品寄給我們,我們會負責項目后續所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始數據分析、生物信息學分析。
SWATH定量蛋白組學服務技術平臺
• 定量鑒定復雜的樣品中所有分子,包括低豐度蛋白和肽段 • 定量準確度高:定量準確度與MRM技術相當 • 通量大:一次實驗可定量檢測到2000種以上蛋白 • 完整全面信息存儲,能夠存儲MS,MS/MS每個峰值的數據,同一樣本無需進行重復檢測 • 無需像MRM技術需要提前調試樣品測定方法
對于復雜樣品定量分析主要的問題往往來自于樣品本身高豐度蛋白的干擾,從而難以鑒定到低豐度蛋白。許多DDA(Data Dependent Acquisition)質譜鑒定方法,都是在MS級別鑒定肽段,優先篩選MS信號強的肽段進行二級碎裂,因此低豐度的肽段不易被選擇進行二級分析。而SWATH/DIA則是對樣品中的所有分子無差別地進行分析,并一次性將所有肽段的MS,MS/MS數據進行儲存,以保證不遺漏任何可能重要的數據。總的來說,SWATH極大地提高了定量分析的可信度,并能夠高效測定復雜樣品中豐度極低的蛋白分子。
DDA與SWATH/DIA質譜分析的對比
另外,相比需要根據待檢測的目標分子進行檢測方法優化,SWATH無偏差分析所有分子,不需要提前對檢測方法進行優化,只需要在已獲得檢測數據的基礎上對分析方法進行優化即可。因此,SWATH分析能夠為您極大得縮短檢測分析的周期。
MRM
SWATH定量蛋白組學服務樣品要求
• SWATH譜圖分析,蛋白質數據質量評估 • 多組分樣本PCA分析 • 鑒定的蛋白功能注釋:GO功能注釋、 KEGG功能注釋和COG功能注釋 • 差異表達蛋白統計分析:韋恩圖、火山圖(Volcano Plot) • 差異表達蛋白聚類分析:層次聚類、K-means聚類 • 差異蛋白相互作用分析:基于STRING數據庫進行蛋白互作網絡分析
在zuì終的技術報告中,百泰派克生物科技會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括: 1. 實驗步驟(中英文) 2. 相關的質譜參數(中英文) 3. 質譜圖片 4. 原始數據 5. 蛋白差異水平分析 6. 生物信息學分析
您只需下單-寄送樣品 百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-數據分析-項目報告
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質,提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種蛋白質標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
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