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深圳市安培生物科技有限公司
中級(jí)會(huì)員 | 第5年

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PCR凝膠電泳問(wèn)題,全都總結(jié)出來(lái)了!

時(shí)間:2024/5/31閱讀:824
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1.Marker相關(guān)問(wèn)題

1.1Marker 不直,偏斜或拖尾

原因:

1.膠配制的問(wèn)題,制作不均勻或有污染或瓊脂糖質(zhì)量不好;

2.電泳緩沖液過(guò)于老舊,考慮更換;

3.電壓太高,凝膠受熱導(dǎo)致不均勻;

4.電泳槽的電極歪斜;


1.2Maker 跑不開(kāi)

原因:

1.膠濃度太大;

2.電泳時(shí)間太短;


2.PCR產(chǎn)物相關(guān)問(wèn)題

2.1沒(méi)條帶

原因:

沒(méi)跑出來(lái)


2.2條帶微弱

原因:

1.DNA降解

2.上樣量過(guò)少

3.沒(méi)跑出來(lái),產(chǎn)物濃度過(guò)低,需再次PCR


2.3非特異性擴(kuò)增

原因:

1.引物設(shè)計(jì)不合理。需重新設(shè)計(jì)引物,balst檢測(cè)引物特異性;

2.試劑被污染。包括水,酶,引物等。重新更換;

3.退火溫度太高。提高退火溫度,增加退火時(shí)間,減少循環(huán)數(shù);

4.酶加入過(guò)多;


2.4 PCR產(chǎn)物彌散,拖尾或偏斜,Maker正常

原因:

1. 引物保存不當(dāng),降解。重新配制引物工作液。

2.模板降解或過(guò)量。重新檢查模板質(zhì)量,減少模板用量。

3.非特異性擴(kuò)增。提高退火溫度,增加退火時(shí)間,減少循環(huán)數(shù)。

4.酶量過(guò)多或酶的質(zhì)量差。

5. 有蛋白和鹽的污染。


2.5 PCR產(chǎn)物和Maker 都彌散或拖尾

原因:

1.膠配制的問(wèn)題,制作不均勻或有污染或瓊脂糖質(zhì)量不好;

2.電泳緩沖液過(guò)于老舊,考慮更換。

3.電壓太高,凝膠受熱導(dǎo)致不均勻。


2.6 PCR產(chǎn)物與目的大小不符合

原因:

1.引物特異性不好。需重新設(shè)計(jì)引物,balst檢測(cè)引物特異性。

2.存在新的異構(gòu)體。

3.是目的基因,但大小有差異(我遇到過(guò))。膠回收過(guò)后再次電泳條帶變?yōu)檎4笮 S龅竭@個(gè)情況可以測(cè)序看看結(jié)果。


2.7 電泳孔亮

原因:有蛋白或者多糖的污染,這些大分子物質(zhì)影響了DNA或RNA的出孔,使其停留在孔中或者出孔很慢。導(dǎo)致孔以及接近孔的位置很亮。

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