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你還在為細(xì)胞計(jì)數(shù)過程中的碎片和雜質(zhì)干擾而煩惱嗎？
閱讀：497 發(fā)布時(shí)間：2021-4-7
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)(scs)是指在單個(gè)細(xì)胞水平上對(duì)其攜帶的遺傳信息進(jìn)行測(cè)序，獲得某種細(xì)胞類型的基因序列等信息并進(jìn)行整合分析，目前廣泛應(yīng)用于新物種鑒定、病原篩查、病原進(jìn)化、發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、腫瘤異質(zhì)性研究以及循環(huán)腫瘤細(xì)胞等。該技術(shù)在2013年榮膺《自然-方法》年度技術(shù)。目前主要的方法為10x Genomics。
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)實(shí)例
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)實(shí)例
1. 多重退火和成環(huán)循環(huán)擴(kuò)增技術(shù)主要研發(fā)人：哈佛大學(xué)終身教授、美國(guó)科學(xué)院院士謝曉亮教授技術(shù)看點(diǎn)：降低PCR擴(kuò)增偏倚，使得單細(xì)胞中93%的基因組能夠被測(cè)序。這種方法使得檢測(cè)單細(xì)胞中較小的DNA序列變異變得更容易，因此能夠發(fā)現(xiàn)個(gè)別細(xì)胞之間的遺傳差異。2. 基于芯片實(shí)驗(yàn)室技術(shù)的單細(xì)胞測(cè)序主要研發(fā)人：斯坦福大學(xué)Stephen Quake技術(shù)看點(diǎn)：基于lap on a chip開發(fā)3. 基于MDA的單細(xì)胞測(cè)序主要研發(fā)人：深圳華大基因研究院技術(shù)看點(diǎn)：將多重置換擴(kuò)增(MDA)和測(cè)序技術(shù)相結(jié)合4. Strand-seq主要研發(fā)人：加拿大英屬哥倫比亞大學(xué)Peter Lansdorp技術(shù)看點(diǎn)：能捕捉DNA一條鏈上的信息，使得研究人員對(duì)于親本DNA模板鏈進(jìn)行DNA測(cè)序，避免單細(xì)胞DNA擴(kuò)增和測(cè)序時(shí)丟失定向信息
收樣與樣本制備過程中的注意事項(xiàng)
1. 樣本類型：細(xì)胞(植物細(xì)胞需要制備成原生質(zhì)體)、組織(一般需要鮮樣不可冷凍)、血液2.最適上機(jī)檢測(cè)濃度：7x105-1.2x106個(gè)/ml3.細(xì)胞活率：細(xì)胞活率大于70%4. 細(xì)胞大小：小于40μm5.細(xì)胞結(jié)團(tuán)率：小于10%
收樣與樣本制備過程中的注意事項(xiàng)
1. 樣本類型：細(xì)胞(植物細(xì)胞需要制備成原生質(zhì)體)、組織(一般需要鮮樣不可冷凍)、血液2.最適上機(jī)檢測(cè)濃度：7x105-1.2x106個(gè)/ml3.細(xì)胞活率：細(xì)胞活率大于70%4. 細(xì)胞大小：小于40μm5.細(xì)胞結(jié)團(tuán)率：小于10%