臭氧發生器應用系統的設計中需要注意的問題有：

1.臭氧發生器的原始氣體不能含有烴類、腐蝕性氣體和其他物質，可以在氧氣/臭氧/電暈環境中安全地與設備發生反應。爆震的三大要素是燃料、氧化劑和著火，而臭氧發生器中有兩種電暈態。

2.供氣壓力不能不加控制地改變，因為壓力會影響電暈功率感應器和施加于介質的電壓。高壓變化范圍大，發電機不可靠，超過電暈功率范圍，熔斷器或自動斷路器就會斷開，加上電壓峰值，介質就會過早失效。

3.污水消毒處理用大型臭氧發生器系統必須設計成能防止大量水進入發電機。水密式供氣壓縮機的浮閥或干燥器的凝汽閥被堵塞，暈室充滿了發電機。電暈室內水分過多會引起高電暈濃度、高電流密度以及介質局部受熱，造成過早失效。