1：大、中型自來水廠供水消毒:目前較為普遍的清毒方法是采用氯氣清毒，由于氯與水中有機物反應會生成致癌的有毒物質，因此西歐等國家已開始限制使用，推廣應用臭氧加氯胺的方法。

2：工礦企業、農村自備井、城鎮小型供水系統消毒，目前較多采用臭氧.次氯酸鈉、漂白粉、二氧化氯法。除臭氧法外以上方法均有二次污染物有毒物質的產生。

3：水池、屋頂水池、水塔等二次供水消毒:由于二次供水系統水在水地或水箱中停留時間過長(不宜超過4個小時)。余氯減少，導致菌類繁殖、蚊蠅滋生。嚴重影響人們的身體健康。因此，越來越引起各方面的重視，國內有的大城市已經就二次供水清毒問題立法，二次消毒目前多采用臭氧、次氯酸鈉、二氧化氯.電子殺菌，紫外線滅菌法。電子滅菌效果不可靠。紫外線在水中穿透力差。而且此兩種方法均無持續滅菌效果。
4：純凈水、礦泉水、食品工業用水消毒:臭氧法為良好選項。

5：污水、中水的消毒，如醫院污水、生活污水、工業廢水、中水回用等。

6：游泳池消毒:由臭氧可自行分解為氧氣，可避免采用氯系滅菌劑對人的眼睛、皮膚的刺激。
7：循環冷卻水的滅菌、除藻。
8：水產品養殖池、育苗池滅菌、即可保證成活率，又不污染水質。