醫院通常分為兩類：綜合醫院和傳染病醫院。就污染物的種類和濃度而言，醫療污水與市政糞便污水相似，但不*相同。醫療污水除一般污染物外，還含有藥物、消毒劑、診斷試劑、洗滌劑等特殊污染物。醫療廢水主要來自各個病房，尤其是各個傳染病病房、手術室、洗衣房排出的污水。除了大量的病原微生物外，寄生蟲卵、蛔蟲卵、肝炎病毒、結核細菌、痢疾細菌等病毒也含有大量的污染物，其中有機物約占總污染的60%，不溶性物質約占40%。由于沉淀過程中有大量不可降解物質如肌肉組織，近年來，放射性同位素已廣泛用于醫療。這些醫療設備經常需要用水清洗，所以清洗后的污水中有放射性。另外，有的醫院有附屬藥廠，排出的廢水含有酸堿等有害物質，這說明醫療污水必須經過消毒和去污處理后才能排入水體。