在氣相色譜中，氣相色譜管線有兩種用途：一種是連接氣源、凈化器和氣相色譜；此外，儀器內部氣路連接——閥門、EPC等連接進樣口和檢測器——也采用不銹鋼管。用于連接氣源、凈化器和氣相色譜儀的不銹鋼管外徑一般為1/8英寸（3.18mm），內徑約為2mm。當氣體流量需求較大時，應選擇其他規格的管徑。
氣相色譜管線需要定期清洗。清洗的一般步驟如下：
1、如果管路油污過多，建議用洗潔精水超聲波清洗刷洗多次，然后用清水多次清洗，用氮氣或無油壓縮空氣吹干或將其干燥；
2、對于油污較少的管道，可用丙酮（或正己烷等其他非極性溶劑）浸泡、超聲波清洗去除油污，可用氮氣或無油污的壓縮空氣進行干燥；
3、進行上述操作后，用去離子水對管道進行浸泡和超聲波清洗，以去除管道上可能存在的酸堿物質；
4、最后用乙醇等低沸點溶劑浸泡，超聲波清洗，去除可能殘留的溶劑、水等物質；清洗后用高純氮氣吹干或用氮氣吹干管道；
5、清洗后的管道應用橡皮帽密封或存放在不易污染的地方使用。
以上就是氣相色譜管線清洗的基本流程，其基本目的是去除油污和酸堿。需要注意的是，如果使用ECD檢測器，應避免使用二氯甲烷或其他鹵代溶劑來清潔與電子捕獲檢測器組合使用的管道。在這些物質*從系統中清除之前，它們會導致基線上升并導致檢測器產生噪音。
