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技術(shù)文章

ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)操作手冊

閱讀:983          發(fā)布時間:2020-2-26

ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(tǒng)主要用于對液體中的浮游動物樣品進(jìn)行計數(shù)、大小測量、種類鑒定以及生物量測定。

ZooSCAN系統(tǒng)是由ZooSCANZooProcessEcoTaxa等共同組成的,ZooSCAN是硬件部分,主要進(jìn)行浮游動物樣品掃描,形成數(shù)字圖像。ZooProcessEcoTaxa是軟件部分,分別以標(biāo)準(zhǔn)化的程序處理原始圖像、對不同個體的形態(tài)參數(shù)進(jìn)行自動測量和對圖像中的浮游動物進(jìn)行自動分類和計數(shù)。

ZooSCAN工作流程

1)掃描空白背景;2)掃描樣品,獲得原始圖片和元數(shù)據(jù)信息;3)使用ZooProcess軟件,標(biāo)準(zhǔn)化原始圖片,提取并測量圖片中不同個體的形態(tài)參數(shù);4) 通過對形態(tài)學(xué)參數(shù)的提取與分析,可進(jìn)一步獲得樣品的粒徑組成、生物學(xué)體積等信息;5)通過EcoTaxa上面已建立的圖像培訓(xùn)數(shù)據(jù)庫,針對已掃描的樣品圖像進(jìn)行浮游動物的自動識別,獲得不同類群浮游動物的數(shù)量。

具體操作流程:

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