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一般認為賴氨酸可以預防骨質疏松癥，骨質疏松癥是血管鈣化的一個特征。戊二酸尿癥ⅰ型和吡哆醇依賴性癲癇的發生是由于缺乏賴氨酸分解代謝途徑。賴氨酸參與一氧化氮合成的調節。它具有抗病毒活性，因此用于治療單純皰疹。賴氨酸與許多生化反應有關，如乙酰化、O-連接的糖基化、泛素化和蛋白質甲基化。一般認為聚賴氨酸是一種生物相容性聚合物，用于跨細胞膜給藥。它可用作磁共振成像中的納米造影劑之一。

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