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質譜流式細胞技術（Mass Cytometry）是利用質譜原理對單細胞進行多參數檢測的流式技術。它繼承了傳統流式細胞儀的高速分析的特點，又具有質譜檢測的高分辨能力，是流式細胞技術一個新的發展方向。
傳統流式細胞技術和質譜流式細胞技術相比，主要有兩點不同：
1、標簽系統的不同，前者主要使用各種熒光基團作為抗體的標簽，后者則使用各種金屬元素作為標簽；
2、檢測系統的不同，前者使用激光器和光電倍增管作為檢測手段，而后者使用ICP質譜技術作為檢測手段。
熒光基團發射光譜一般比較寬，其間往往會發生重疊，會帶來一些問題：
一方面限制了檢測通道的數量（<20個）；
另一方面，它會帶來嚴重的串色問題，很多通道的信號需要復雜的補償計算。由于利用ICP質譜作為檢測手段，與傳統流式細胞技術相比，質譜流式細胞技術具有以下優勢。
應用領域：
質譜流式細胞技術可以實現對細胞群體進行精準的免疫分型，對細胞內信號傳導網絡進行全面的分析，分析細胞亞群之間的功能聯系，以及對于大量樣品的高通量多參數檢測。在造血、免疫、干細胞、癌癥以及藥物篩選等多個領域的研究有著廣泛的應用前景。
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