水質自動采樣器在水質檢測過程中，水樣的采集和儲存是水質分析的重要環節。為了獲得準確、全面的水質分析數據，需要采用正確的取樣方法和水樣保存方法，及時送樣進行分析檢測。正確的取樣和保存方法是獲得可靠檢測結果的前提。
水樣采集和保存的主要原則：
（1）水樣必須具有足夠的代表性；
（2）水樣必須沒有任何意外污染。
既然水樣的采集和儲存如此關鍵，那么水質自動采樣器對水樣的采集和儲存有什么要求呢？應該注意什么？
1、水樣采集
（1）選擇特定的采樣位置，避免采樣器或采樣裝置進水口受到周圍環境的污染，包括采樣器手指污染的可能性。尤其是采集有微生物指標的水樣，使用前要求嚴格無菌，因此容器必須干熱或濕熱滅菌。
（2）進水取樣器取樣前，應先放水幾分鐘，尤其是用抽水設備采集自來水或井水時，以沖洗掉積聚在水管或取樣器管路中的雜質。
（3）采集水樣后立即給水容器（水樣瓶）貼上標簽或在水樣手冊上詳細記錄。水樣手冊的內容應包括采樣時的位置、日期、時間、水源類型、水樣、水位、周圍水源和排放口、水溫、氣溫、氣候條件、分析目的和物品，以及采樣水的人。
2、水樣的保存
使用水質自動采樣器采集水樣后，應盡快進行分析檢查。某些項目還需要現場測量水中的溶解氧、二氧化碳、硫化氫、游離氯等。但由于各種條件（如儀器、場地等）的限制，往往只能現場進行少數幾個測量項目（溫度、電導率、pH值等），大部分項目仍需要送到實驗室進行測量。
因此，水樣的保存是一個非常重要的問題。水樣采集后，如果保存不當，水中的物質通常會發生物理、化學和生物變化。
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