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哺乳動物細胞真核表達系統(tǒng)在表達過程中有翻譯后修飾和折疊的功能，這一特點使其蛋白更接近天然蛋白，具備天然蛋白必須的空間結構和修飾，與天然蛋白有相同的生物活性，哺乳動物細胞表達系統(tǒng)在功能蛋白、抗體生產(chǎn)、臨床疫苗的研發(fā)和生產(chǎn)中應用較為廣泛。
原核表達系統(tǒng)具有表達水平高、操作簡單、周期短、易于大規(guī)模高密度培養(yǎng)、成本低等優(yōu)點，而對于全抗體和糖蛋白類生物藥物來說，表達產(chǎn)物多肽鏈的折疊、二硫鍵的形成、糖基化的有無以及糖基化的類型常常影響表達產(chǎn)物的合成分泌、生物活性、體內(nèi)穩(wěn)定性以及免疫原性等特性。由于原核細胞缺少內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體等可用于進行糖基化的結構和機制，所表達產(chǎn)物是非糖基化的，且常以包涵體的形式存在；
酵母、昆蟲及植物等真核細胞雖能進行糖基化，但其糖基化的方式與人類等哺乳動物細胞糖基化的方式是不一樣的。與其它真核細胞表達系統(tǒng)相比，目的基因在哺乳動物細胞中表達的蛋白與天然蛋白的結構、糖基化類型和方式幾乎相同且能正確組裝成多亞基蛋白，并且哺乳動物細胞能以懸浮培養(yǎng)或在無血清的培養(yǎng)基中達到高密度且培養(yǎng)體積能達到1000L以上。
總之，與其他系統(tǒng)相比，哺乳動物細胞表達系統(tǒng)的優(yōu)勢在于能夠指導蛋白的正確折疊，提供復雜的N型糖基化和準確的O型糖基化等多種翻譯后加工功能，因而表達產(chǎn)物在分子結構、理化性質(zhì)和生物學功能方面接近于天然的高等生物蛋白質(zhì)分子。
